田中 龍聖 (タナカ リュウセイ)




医学部 医学科 感染症学講座寄生虫学分野





論文 【 表示 / 非表示

  • Differentially Expressed Genes Associated with Body Size Changes and Transposable Element Insertions between Caenorhabditis elegans and Its Sister Species, Caenorhabditis inopinata. 査読あり

    Kawahara K, Inada T, Tanaka R, Dayi M, Makino T, Maruyama S, Kikuchi T, Sugimoto A, Kawata M

    Genome biology and evolution   15 ( 4 )   2023年4月


    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/gbe/evad063


  • Population genetics study of Strongyloides fuelleborni and phylogenetic considerations on primate-infecting species of Strongyloides based on their mitochondrial genome sequences 査読あり

    Ko P.P., Haraguchi M., Hara T., Hieu D.D., Ito A., Tanaka R., Tanaka M., Suzumura T., Ueda M., Yoshida A., Maruyama H., Nagayasu E.

    Parasitology International   92   102663   2023年2月


    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Parasitology International  

    Strongyloides is a genus of parasitic nematodes of vertebrates comprising approximately 50 documented species, each with various host ranges. Among these, three species (S. stercoralis, S. fuelleborni, and S. cebus) are known to infect primate hosts. S. fuelleborni typically infects non-human primates in the Old World. To complement the existing information on the global genetic structure of this species, we conducted a genotyping study of S. fuelleborni samples collected from rhesus macaques in Myanmar, Japanese macaques in Japan, and some zoo-kept primates. This study identified a novel haplotype group in isolates from the Myanmar rhesus macaques. Subsequently, we obtained the complete or nearly complete mitochondrial genome sequences of S. fuelleborni, S. cebus (Strongyloides of New World monkeys), and S. vituli (Strongyloides of cattle). Phylogenetic analysis based on concatenated mitochondrial protein sequences of various Strongyloides species indicated a close relationship between S. fuelleborni, S. vituli and S. papillosus (Strongyloides in sheep and cattle). S. cebus is quite distantly related to both S. fuelleborni and S. stercoralis, which led to the hypothesis that the three primate Strongyloides species evolved independently as parasites of primates.

    DOI: 10.1016/j.parint.2022.102663



  • The compact genome of Caenorhabditis niphades n. sp., isolated from a wood-boring weevil, Niphades variegatus 査読あり 国際共著

    Sun S., Kanzaki N., Dayi M., Maeda Y., Yoshida A., Tanaka R., Kikuchi T.

    BMC Genomics   23 ( 1 )   765   2022年12月


    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BMC Genomics  

    Background: The first metazoan genome sequenced, that of Caenorhabditis elegans, has motivated animal genome evolution studies. To date > 50 species from the genus Caenorhabditis have been sequenced, allowing research on genome variation. Results: In the present study, we describe a new gonochoristic species, Caenorhabditis niphades n. sp., previously referred as C. sp. 36, isolated from adult weevils (Niphades variegatus), with whom they appear to be tightly associated during its life cycle. Along with a species description, we sequenced the genome of C. niphades n. sp. and produced a chromosome-level assembly. A genome comparison highlighted that C. niphades n. sp. has the smallest genome (59 Mbp) so far sequenced in the Elegans supergroup, despite being closely related to a species with an exceptionally large genome, C. japonica. Conclusions: The compact genome of C. niphades n. sp. can serve as a key resource for comparative evolutionary studies of genome and gene number expansions in Caenorhabditis species.

    DOI: 10.1186/s12864-022-09011-8



  • ノキシノブ葉面から分離された菌類

    柴田 紗帆, 岸本 圭子, 田中 龍聖, 竹本 周平, 廣岡 裕吏

    日本森林学会大会発表データベース   133 ( 0 )   639   2022年5月


    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(研究会,シンポジウム資料等)   出版者・発行元:日本森林学会  

    葉の表面を指す葉面(phylloplane)は,陸上微生物最大の生息場所の1つと考えられている.この葉面上には,植物を基質とする菌類だけでなく,葉面上の他の生物,花粉や塵といった堆積物などを基質とする多様な菌類種が存在すると考えられている.しかしながら,葉面に存在する菌類(葉面菌)は胞子や酵母,菌糸などの単純な形態で存在することや,その単純な形態ゆえに種同定が極めて難しいことから,生態学的役割について未解明な点が多い.そこで本研究では,葉面菌の生態学的役割解明に向けたそれら菌の同定基盤の構築を目指し,林内で容易に観察されるノキシノブ(常緑シダ植物の一種)の葉面より分離された菌類の多様性解明を行なった.異なる地域や時期に採取したノキシノブ71標本の葉面から420菌株を分離し,rDNA LSU領域の塩基配列を用いてそれら菌株の簡易同定を行なった.そして,そのうち分離頻度の高い17種について,詳細な種同定を行った結果,約半数にあたる8種は未記載種と考えられた.今後,葉面菌の生態学的役割を明らかにするためには,これら多様な菌類のさらなる分類学的研究が必要である.

    DOI: 10.11519/jfsc.133.0_639

    CiNii Research

  • Additional description and genome analyses of Caenorhabditis auriculariae representing the basal lineage of genus Caenorhabditis 査読あり 国際共著

    Dayi M., Kanzaki N., Sun S., Ide T., Tanaka R., Masuya H., Okabe K., Kajimura H., Kikuchi T.

    Scientific Reports   11 ( 1 )   6720   2021年12月


    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Scientific Reports  

    Caenorhabditis auriculariae, which was morphologically described in 1999, was re-isolated from a Platydema mushroom-associated beetle. Based on the re-isolated materials, some morphological characteristics were re-examined and ascribed to the species. In addition, to clarify phylogenetic relationships with other Caenorhabditis species and biological features of the nematode, the whole genome was sequenced and assembled into 109.5 Mb with 16,279 predicted protein-coding genes. Molecular phylogenetic analyses based on ribosomal RNA and 269 single-copy genes revealed the species is closely related to C. sonorae and C. monodelphis placing them at the most basal clade of the genus. C. auriculariae has morphological characteristics clearly differed from those two species and harbours a number of species-specific gene families, indicating its usefulness as a new outgroup species for Caenorhabditis evolutionary studies. A comparison of carbohydrate-active enzyme (CAZy) repertoires in genomes, which we found useful to speculate about the lifestyle of Caenorhabditis nematodes, suggested that C. auriculariae likely has a life-cycle with tight-association with insects.

    DOI: 10.1038/s41598-021-85967-z



全件表示 >>

書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  • Nematodes Exploiting P. japonensis

    Toyoshi Yoshiga, Ryusei Tanaka, Etsuko Okamura( 担当: 分担執筆)

    Springer Nature  2022年10月 



  • 生き物と音の辞典

    高梨 琢磨 他( 担当: 共著 ,  範囲: 線虫の振動受容)

    朝倉書店  2019年9月 


    総ページ数:441   担当ページ:336-337   記述言語:日本語 著書種別:学術書


講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • ネズミ糞線虫Strongyloides rattiの自由生活世代と細菌の関係


    第92回日本寄生虫学会大会  2022年5月 


    開催年月日: 2022年5月30日 - 2022年5月31日


  • Relationship of Caenorhabditis inopinata with the wasp and bacteria in the fig ecosystem 国際会議

    Ryusei Tanaka, Tanzila Afrin and Taisei Kikuchi

    Seventh International Congress of Nematology  2022年5月 


    開催年月日: 2022年5月1日 - 2022年5月6日


  • オオバイヌビワ果実内部の線虫の動態

    田中龍聖,Afrin tanzila,菊地泰生

    2018 日本線虫学会大会   (熊本)  日本線虫学会


    開催年月日: 2018年9月5日 - 2018年9月6日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  


  • イチジク果実内部に生息する線虫Caenorhabdits sp. 34 の餌としての細菌




    開催年月日: 2016年9月14日 - 2016年9月16日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  • Ecology of Caenorhabditis sp. 34 国際会議

    Ryusei Tanaka and Taisei Kikuchi

    European Society of Nematologists 


    開催年月日: 2016年8月28日 - 2016年9月1日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

全件表示 >>

科研費(文科省・学振・厚労省)獲得実績 【 表示 / 非表示

  • イチジク果実内の生物群の共進化

    2016年04月 - 2019年03月

    科学研究費補助金  若手研究(B)




授業 【 表示 / 非表示

  • 生命と病気

  • 環境と生命