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所属 |
研究・産学地域連携推進機構 テニュアトラック推進室 |
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職名 |
准教授 |
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研究分野 【 表示 ／ 非表示 】
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ライフサイエンス / 森林科学
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ライフサイエンス / 生態学、環境学
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環境・農学 / 生物資源保全学
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環境・農学 / 遺伝育種科学
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ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学
論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Effects of Pieris japonica (Ericaceae) dominance on cool temperate forest altered-understory environments and soil microbiomes in Southern Japan. 査読あり
Tokumoto Y, Katayama A
PloS one 19 ( 1 ) e0296692 2024年
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Distribution of Plant Hormones and Their Precursors in Cambial Region Tissues of Quercus myrsinifolia and Castanopsis cuspidata var.sieboldii after Bending Stems or Applying Ethylene precursor 査読あり
Yoshio Kijidani, Taku Tsuyama, Yuji Tokumoto
Forests 14 ( 4 ) 813 - 813 2023年4月
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Upregulation of MAP kinase HOG1 gene of white-rot fungus Phlebia sp. MG-60 inhibits the ethanol fermentation and mycelial growth. 査読あり
Motoda T, Chen FC, Tsuyama T, Tokumoto Y, Kijidani Y, Kamei I
Bioscience, biotechnology, and biochemistry 87 ( 2 ) 217 - 227 2023年1月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Oxford University Press ({OUP})
Wood biomass conversion for fossil resource replacement could result in the sustainable production of chemicals, although lignin represents an obstacle to efficient polysaccharide use. White-rot fungus Phlebia sp. MG-60 reportedly selectively and aerobically degrades lignin in hardwood, then it begins cellulose saccharification from the delignified wood to produce ethanol. Environmental conditions might change white-rot fungi-driven biomass conversion. However, how the environmental response sensor affects ethanol fermentation in white-rot fungi remains elusive. In this study, we focused on MGHOG1, the yeast Hog1 homolog in Phlebia sp. MG-60, a presumably important player in osmoresponse. We generated MGHOG1 overexpressing (OE) transformants in Phlebia sp. MG-60, exhibiting slower mycelial growth compared with the wild-type under salinity stress. MGHOG1 overexpressing liquid cultures displayed suppressed mycelial growth and ethanol fermentation. Therefore, MGHOG1 potentially influences ethanol fermentation and mycelial growth in Phlebia sp. MG-60. This study provides novel insights into the regulation of white-rot fungi-mediated biomass conversion.
DOI： 10.1093/bbb/zbac203
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Utility of commercial high‐resolution satellite imagery for monitoring general flowering in Sarawak, Borneo 査読あり 国際共著
Tomoaki Miura, 徳本 雄史, 永井 信, Kentaro K. Shimizu, Runi Anak Sylvester Pungga, 市榮 智明
Ecological Research 38 386 - 402 2023年
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Effects of soil environmental changes accompanying soil erosion on the soil prokaryotes and fungi of cool temperate forests in Southern Japan 査読あり
Fu Chia Chen, Ayumi Katayama, Mimori Oyamada, Taku Tsuyama, Yoshio Kijidani, Yuji Tokumoto
Journal of Forest Research 2023年
掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Soil erosion, which involves the degradation of the physical and chemical properties of soil, is a major threat to the soil environment. Although the effects of soil erosion on the physical or chemical properties of forests have been studied, little has been reported on the soil microbial community, which is likely to affect forest ecosystems. This study aimed to elucidate how the microbiome changed with the soil environment accompanying soil erosion in cool temperate mixed forests in Southern Japan, where soil erosion has been accelerated by the increased population of sika deer. We investigated the soil microbial communities of the different soil erosion intensities at three forest sites. In prokaryotic communities, diversity indices were increased with the sum of the height of exposed roots (SUMH), an index of soil erosion. In fungal communities, the relative abundances of plant pathogenic and wood saprotroph fungi were increased as SUMH increased and those of symbiotrophs and ectomycorrhizal fungi were increased with humus organic matter content, suggesting that the difficulties in establishing plants would be increased as soil erosion progressed because of the changes in the composition and function of fungal communities in eroded areas. Moreover, soil fungal communities had a more complex co-occurrence network than that of prokaryote, suggesting that the effects of soil erosion on fungal network is smaller than those on bacterial network. Changes in the soil environment induced by soil erosion altered the microbiomes in the deeper layers of the soil and had different effect on prokaryotes and fungi.
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
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白色腐朽菌Phlebia sp.MG-60株におけるMAPキナーゼHOG1の過剰発現はエタノール発酵と菌糸成長を抑制する
元田多一, 陳富嘉, 津山濯, 徳本雄史, 亀井一郎, 雉子谷佳男
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM) 73rd 2023年
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九州の冷温帯林におけるアセビ(ツツジ科)の繁茂が土壌環境と微生物群集に及ぼす影響
徳本雄史, 片山歩美
日本生態学会大会講演要旨(Web) 70th 2023年
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九州山地における防鹿柵内外でのブナ樹冠下環境と土壌微生物相の違い
櫻井優樹, 片山歩美, 阿部隼人, 津山濯, 徳本雄史
日本森林学会大会学術講演集 134th 2023年
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下層植生の衰退した広葉樹林におけるUAVを用いた土壌侵食量の面的評価
宮﨑 拓馬, 篠原 慶規, 徳本 雄史, 片山 歩美, 久米 朋宣
日本森林学会大会発表データベース 133 ( 0 ) 522 2022年5月
記述言語：英語 掲載種別：速報，短報，研究ノート等（学術雑誌） 出版者・発行元：日本森林学会
現在日本では、人工林の管理不足やシカ食害により、下層植生が衰退し、土壌侵食が進行している森林がある。森林での土壌侵食は、土砂災害発生の要因となるだけでなく、森林・河川生態系にも影響を与える可能性がある。土壌侵食の研究は数多く行われているが、その多くは、土砂受け箱などを用いて土壌侵食量を計測するものであった。これらは、土壌侵食量を定量的に評価することは可能であるが、空間的ばらつきは評価できない。そこで新たなアプローチとして、UAVによる空撮画像から三次元モデルを構築し、土壌の侵食と堆積の面的評価が可能かどうかを検証した。2021年7、9、11月に、シカ食害の進行した九州大学宮崎演習林において林内でUAVによる空撮を行い、SfM-MVS技術を用いて林床地形の点群データを作成した。また、9、11月では、地上レーザーによる点群データ作成を行い、UAVから得られた点群データと比較した。その結果、同時期に作成したUAV点群と地上レーザー点群はほぼ一致した。また、異なる時期に作成したUAV点群を比較したところ、土壌侵食が起こっていると考えられる場所では、データからも土壌侵食が見て取れた。
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東南アジアのフェノロジーの理解に向けたmulti-speciesトランスクリプトーム解析
徳本雄史, 徳本雄史, 徳本雄史, 永井信, 久米朋宣, 清水健太郎, 清水健太郎
日本生態学会大会講演要旨(Web) 69th 2022年
科研費（文科省・学振・厚労省）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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下層植生消失によるブナの水・養分ストレスが土壌生物多様性と生態系機能に与える影響
研究課題/領域番号：22H03793 2022年04月 - 2026年03月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 基盤研究(B)
片山 歩美, 東 若菜, 徳本 雄史, 菱 拓雄, 久米 朋宣
担当区分：研究分担者
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東南アジアの植生回復に向けた先駆樹種の機能と遷移後期樹種との種間相互作用系の解明
研究課題/領域番号：22K05692 2022年04月 - 2026年03月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C)
徳本 雄史, 市榮 智明
担当区分：研究代表者
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高頻度・高空間分解能衛星による日本とボルネオの常緑広葉樹の種判別と広域マッピング
研究課題/領域番号：22K12352 2022年04月 - 2026年03月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C) 基盤研究(C)
永井 信, 遠藤 拓洋, 徳本 雄史, 市榮 智明
担当区分：研究分担者
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トランスクリプトーム解析による東南アジア熱帯の群集レベルのフェノロジー現象の解明
研究課題/領域番号：19K15875 2019年04月 - 2022年03月
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究 若手研究
徳本 雄史
担当区分：研究代表者
本研究では東南アジア熱帯の林冠で見られるフタバガキ科、マメ科、カキ科の個体を対象として、フェノロジーと気象データ、そして発現遺伝子との関係から、種レベルかつ群集レベルのフェノロジー現象を明らかにすることを目的とした。調査期間中に降水量の低下と群集レベルの開花が起こり、調査対象の個体の多くが開花した。発現遺伝子の解析から、開花前に乾燥応答の遺伝子と低温応答の遺伝子のいずれかまたは両方の発現量が変化していた。これは同調開花のトリガーとされてきた乾燥と低温の２つが、複数の林冠樹種で発現遺伝子のレベルから確認されたことと、林冠樹種が機微な気象条件の変化で生物季節的な現象を起こしていることが示唆された。