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農学部 獣医学科 |
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論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Genetic variation in the human olfactory receptor OR5AN1 associates with the perception of musks. 査読あり
Sato-Akuhara N, Trimmer C, Keller A, Niimura Y, Shirasu M, Mainland JD, Touhara K
Chemical Senses 48 bjac037 2023年1月
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Structural model for ligand binding and channel opening of an insect gustatory receptor. 査読あり
Morinaga S, Nagata K, Ihara S, Yumita T, Niimura Y, Sato K, Touhara K
The Journal of Biological Chemistry 298 ( 11 ) 102573 2022年10月
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Genetic variation of olfactory receptor gene family in a Japanese population. 査読あり 国際共著
Akhtar MS, Ashino R, Oota H, Ishida H, Niimura Y, Touhara K, Melin AD, Kawamura S
Anthropological Science 130 ( 2 ) 93 - 106 2022年7月
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The genomics of ecological flexibility, large brains, and long lives in capuchin monkeys revealed with fecalFACS. 査読あり 国際誌
Orkin JD, Montague MJ, Tejada-Martinez D, de Manuel M, Del Campo J, Cheves Hernandez S, Di Fiore A, Fontsere C, Hodgson JA, Janiak MC, Kuderna LFK, Lizano E, Martin MP, Niimura Y, Perry GH, Valverde CS, Tang J, Warren WC, de Magalhães JP, Kawamura S, Marquès-Bonet T, Krawetz R, Melin AD
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118 ( 7 ) 2021年2月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Ecological flexibility, extended lifespans, and large brains have long intrigued evolutionary biologists, and comparative genomics offers an efficient and effective tool for generating new insights into the evolution of such traits. Studies of capuchin monkeys are particularly well situated to shed light on the selective pressures and genetic underpinnings of local adaptation to diverse habitats, longevity, and brain development. Distributed widely across Central and South America, they are inventive and extractive foragers, known for their sensorimotor intelligence. Capuchins have among the largest relative brain size of any monkey and a lifespan that exceeds 50 y, despite their small (3 to 5 kg) body size. We assemble and annotate a de novo reference genome for Cebus imitator Through high-depth sequencing of DNA derived from blood, various tissues, and feces via fluorescence-activated cell sorting (fecalFACS) to isolate monkey epithelial cells, we compared genomes of capuchin populations from tropical dry forests and lowland rainforests and identified population divergence in genes involved in water balance, kidney function, and metabolism. Through a comparative genomics approach spanning a wide diversity of mammals, we identified genes under positive selection associated with longevity and brain development. Additionally, we provide a technological advancement in the use of noninvasive genomics for studies of free-ranging mammals. Our intra- and interspecific comparative study of capuchin genomics provides insights into processes underlying local adaptation to diverse and physiologically challenging environments, as well as the molecular basis of brain evolution and longevity.
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Origin and Evolution of the Gene Family of Proteinaceous Pheromones, the Exocrine Gland-Secreting Peptides, in Rodents. 査読あり 国際誌
Niimura Y, Tsunoda M, Kato S, Murata K, Yanagawa T, Suzuki S, Touhara K
Molecular biology and evolution 38 ( 2 ) 634 - 649 2021年1月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
The exocrine-gland secreting peptide (ESP)gene family encodes proteinaceous pheromones that are recognized by the vomeronasal organ in mice. For example, ESP1 is a male pheromone secreted in tear fluid that regulates socio-sexual behavior, and ESP22 is a juvenile pheromone that suppresses adult sexual behavior. The family consists of multiple genes and has been identified only in mouse and rat genomes. The coding region of a mouse ESP gene is separated into two exons, each encoding signal and mature sequences. Here, we report the origin and evolution of the ESP gene family. ESP genes were found only in the Muridea and Cricetidae families of rodents, suggesting a recent origin of ESP genes in the common ancestor of murids and cricetids. ESP genes show a great diversity in number, length, and sequence among different species as well as mouse strains. Some ESPs in rats and golden hamsters are expressed in the lacrimal gland and the salivary gland. We also found that a mature sequence of an ESP gene showed overall sequence similarity to the α-globin gene. The ancestral ESP gene seems to be generated by recombination of a retrotransposed α-globin gene with the signal-encoding exon of the CRISP2 gene located adjacent to the ESP gene cluster. This study provides an intriguing example of molecular tinkering in rapidly evolving species-specific proteinaceous pheromone genes.
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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Major gene families in humans and their evolutionary history [Video file].
Niimura Y（ 担当： 単著）
Henry Stewart Talks 2022年3月
記述言語：英語 著書種別：教科書・概説・概論
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ヒトゲノム事典
新村芳人（ 担当： 単著 , 範囲: 嗅覚にかかわる遺伝子）
一色出版 2021年11月 （ ISBN:4910389121 ）
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The Senses: A Comprehensive Reference (2nd Edition)
Bernd Fritzsch（ 担当： 分担執筆 , 範囲: Mammalian Olfactory and Vomeronasal Receptor Families.）
Academic Press 2020年
記述言語：英語
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
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進化のじかん(44) 五感の遺伝子をめぐる冒険 味覚編（５）塩味・酸味・脂肪味
新村芳人
現代化学 624 16 - 18 2023年3月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
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遺伝子研究からみた嗅覚の世界 第５回 フェロモン受容体へと至る道
新村芳人
サノフィ e-MR 2023年2月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
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宮崎大学農学部獣医学科・獣医遺伝情報学研究室
新村芳人
宮崎県獣医師会だより ( 96 ) 38 - 39 2023年1月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他）
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進化のじかん(43) 五感の遺伝子をめぐる冒険 味覚編（４）ネコの舌、ハチドリの秘密
新村芳人
現代化学 622 23 - 25 2023年1月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
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進化のじかん(42) 五感の遺伝子をめぐる冒険 味覚編（３）苦味の話
新村芳人
現代化学 621 17 - 19 2022年12月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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遺伝子から探る 嗅覚の進化
新村芳人
令和4年度 九大・宮大・九工大合同研究報告会 2022年9月12日
開催年月日： 2022年9月12日 - 2022年9月13日
会議種別：口頭発表（一般）
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遺伝子から探る嗅覚の進化 招待あり
新村芳人
第140回 宮崎大学農学部獣医学科集談会 2022年3月5日
開催年月日： 2022年3月5日
記述言語：日本語 会議種別：口頭発表（一般）
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ゲノムデータが解き明かす嗅覚の進化
新村芳人
第83回 宮崎大学イブニングセミナー 2022年3月3日
開催年月日： 2022年3月3日
記述言語：日本語 会議種別：口頭発表（招待・特別）
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Comparative Evolutionary Analysis of Chemosensory Receptor Genes among Hystricomorpha 招待あり 国際共著
Yoshihito Niimura
Accelerating Social Implementation for SDGs Achievement (aXis) Online Workshop, Promotion of domestication of giant rodent grass cutters for environmental protection and food safety in West Africa 2022年2月18日
開催年月日： 2022年2月18日
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（招待・特別）
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食用大型齧歯類グラスカッター（Thryonomys swinderianus）の全ゲノム配列決定：ヤマアラシ亜目における化学感覚受容体遺伝子の比較進化解析
新村芳人、Bhim Biswa、岸田拓士、豊田敦、村山美穂、Scott Jenkins、Christopher Adenyo、Boniface B. Kayang、小出剛
第44回 日本分子生物学会年会人類学会大会 2021年12月3日
開催年月日： 2021年12月
記述言語：日本語 会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）
科研費（文科省・学振・厚労省）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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環境への適応を特徴づける哺乳類嗅覚受容体遺伝子の探索とその機能解析
研究課題/領域番号：22K06341 2022年04月 - 2026年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
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オーソログ遺伝子群を用いた嗅覚受容体遺伝子のゲノム進化解析と環境要因との相関
研究課題/領域番号：18K06359 2018年04月 - 2023年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者