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医学部 医学科 機能制御学講座機能生化学分野 |
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准教授 |
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論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Role of cytoplasmic acetyltransferases, NAA60 and HAT1, in cellular protection against genotoxic agents 査読あり 国際共著
Satrimafitrah Pasjan, Nishitoh Hideki, Takami Yasunari
Fundamental Toxicological Sciences 9 ( 6 ) 179 - 186 2022年
担当区分：最終著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：一般社団法人 日本毒性学会
Histone acetyltransferases (HATs) are separated into two types. Type A HATs act on nucleosomal histones and thus primarily function in transcriptional regulation, while cytoplasmic HATs (type B) are known as enzymes that modify free histones before their assembly into chromatin, and may also function outside the nucleus. N-alpha-acetyltransferase 60 (NAA60) is the most recently discovered type B HATs, which are also known as N-terminal acetyltransferases (NATs) and are found only in multicellular eukaryotes. NAA60 localizes to the Golgi complex and possesses a unique ability to catalyze the acetylation of membrane-anchored proteins at the N-terminus and free histones at the lysine side chains, the biological significance of which remains unclear. To investigate the cellular functions of NAA60 and its relation to other cytoplasmic HATs, Hat1, we generated <i>NAA60-</i> or <i>HAT1-</i>deficient cells and <i>NAA60/HAT1-</i>double deficient cells using a chicken B lymphocyte leukemia DT40 cell line. Although NAA60-deficient cells did not show any impairment in cell growth and showed a slight sensitivity to DNA damage agents, <i>NAA60/HAT1-</i>double deficient cells exhibited an additive increase in sensitivity to methyl methanesulfonate (MMS) and 4-nitroquinoline 1-oxide (4-NQO) when compared to <i>HAT1-</i>deficient cells, which were previously reported to be moderately sensitive to these agents. These results predict that each type B HATs might contribute differently in regulation of repair of chemical induced DNA lesions.
DOI： 10.2131/fts.9.179
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Kijima M., Yamagishi H., Hara Y., Kasai M., Takami Y., Takemura H., Miyanari Y., Shinkai Y., Mizuta R.
Biochemical and Biophysical Research Communications 512 ( 2 ) 202 - 207 2019年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Biochemical and Biophysical Research Communications
© 2019 Elsevier Inc. Although chromatin condensation is a well-known hallmark of apoptosis, the generation mechanism has not been clarified. Histone H1, a positively-charged abundant nuclear protein, is located in the linker region of chromatin. There are several Histone H1 subtypes that are encoded by variant genes. Using serial histone H1-deletion mutant cells established from the chicken B-cell leukemia line DT40, we found that apoptotic chromatin condensation was decreased in relation to histone H1 protein level and that the chromatin in nuclei prepared from the live null mutant cells had a high accessibility of DNases and transposase. This indicated that linker histone H1 was the general chromatin condensation factor and that the loss of histone H1 generated open chromatin in both apoptotic and live cells.
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Kadowaki H., Satrimafitrah P., Takami Y., Nishitoh H.
Scientific Reports 8 ( 1 ) 7317 2018年12月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Scientific Reports
© 2018 The Author(s). The maintenance of endoplasmic reticulum (ER) homeostasis is essential for cell function. ER stress-induced pre-emptive quality control (ERpQC) helps alleviate the burden to a stressed ER by limiting further protein loading. We have previously reported the mechanisms of ERpQC, which includes a rerouting step and a degradation step. Under ER stress conditions, Derlin family proteins (Derlins), which are components of ER-associated degradation, reroute specific ER-targeting proteins to the cytosol. Newly synthesized rerouted polypeptides are degraded via the cytosolic chaperone Bag6 and the AAA-ATPase p97 in the ubiquitin-proteasome system. However, the mechanisms by which ER-targeting proteins are rerouted from the ER translocation pathway to the cytosolic degradation pathway and how the E3 ligase ubiquitinates ERpQC substrates remain unclear. Here, we show that ERpQC substrates are captured by the carboxyl-terminus region of Derlin-1 and ubiquitinated by the HRD1 E3 ubiquitin ligase prior to degradation. Moreover, HRD1 forms a large ERpQC-related complex composed of Sec61α and Derlin-1 during ER stress. These findings indicate that the association of the degradation factor HRD1 with the translocon and the rerouting factor Derlin-1 may be necessary for the smooth and effective clearance of ERpQC substrates.
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Acetylation of histone H4 lysine 5 and 12 is required for CENP-A deposition into centromeres. 査読あり
Wei-Hao Shang, Tetsuya Hori, Frederick G. Westhorpe, Kristina M. Godek, Atsushi Toyoda, Sadahiko Misu, Norikazu Monma, Kazuho Ikeo, Christopher W. Carroll, Yasunari Takami, Asao Fujiyama, Hiroshi Kimura, Aaron F. Straight, Tatsuo Fukagawa
Nature Communications 7 ( 13465 ) 1 - 13 2016年11月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1038/ncomms13465
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RbAp48 is essential for viability of vertebrate cells and plays a role in chromosome stability 査読あり
Satrimafitrah P., Barman H., Ahmad A., Nishitoh H., Nakayama T., Fukagawa T., Takami Y.
Chromosome Research 24 ( 2 ) 161 - 173 2016年5月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Chromosome Research
© 2015, Springer Science+Business Media Dordrecht. RbAp46/48, histone chaperone, is a family of evolutionarily conserved WD40 repeat-containing proteins, which are involved in various chromatin-metabolizing processes, but their in vivo functional relevance is yet unclear. In order to examine the biological role of pRbAp48 in chicken DT40 cells, we generated a tetracycline-inducible system for conditional RbAp48-knockout cells. Depletion of RbAp48 led to delayed S phase progression associated with slow DNA synthesis and nascent nucleosome formation, followed by accumulation in G2/M phase, finally leading to cell death. Prior to cell death, these cells exhibited aberrant mitosis such as highly condensed and abnormal chromosome alignment on the metaphase plate, leading to chromosome missegregation. Depletion of RbAp48 also caused dissociation of heterochromatin protein 1 (HP1) from pericentromeric heterochromatin. Furthermore, depletion of RbAp48 from cells led to elevated levels of acetylation and slightly decreased levels of methylation, specifically at Lys-9 residue of histone H3. These results suggest that RbAp48 plays an important role in chromosome stability for proper organization of heterochromatin structure through the regulation of epigenetic mark.
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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Advances in Genetics Research vol.2. (Studies on epigenetic control of B cell functions using the DT40 cell line)
Hidehiko Kikuchi, Hirak Kumar Barman, Masami Nakayama, Yasunari Takami, Tatsuo Nakayama（ 担当： 共著）
Urbano (Ed). Nova Science Publishers 2010年3月
記述言語：英語 著書種別：学術書
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Reviews and Protocol in DT40 Research
Kikuchi H., Barman H K., Nakayama M., Takami Y., and Nakayama T.（ 担当： 共著 , 範囲: 部分執筆）
Springer-Verlag (Verlin) 2006年4月
記述言語：英語 著書種別：学術書
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
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クロマチン構築を介したDNA複製制御
高見恭成
蛋白質 核酸 酵素 54 ( 4 ) 496 - 501 2009年4月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア） 出版者・発行元：共立出版
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Participation of histones and histone-modifying enzymes in cell functions through alterations in chromatin structure.
Nakayama T., and Takami Y.
Journal of Biochemistry 29 491 - 499 2001年4月
記述言語：英語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌） 出版者・発行元：Journal of Biochemistry
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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RbAp48 is essential for the viability and plays a role for chromosome stability in vertebrate Cells
Pasjan Satrimafitrah, Hirak Kumar Barman, Ahyar Ahmad , Hideki Nishitoh, Tatsuo Nakayama, Tatsuo Fukagawa, Yasunari Takami
平成２７年度日本生化学会九州支部会 (九州大学箱崎 キャンパス) 日本生化学会九州支部
開催年月日： 2015年5月16日 - 2015年5月17日
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）
開催地：九州大学箱崎 キャンパス
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RbAp48 is essential for the viability and plays a role for chromosome stability in vertebrate Cells 国際会議
Pasjan Satrimafitrah, Hirak Kumar Barman, Ahyar Ahmad , Hideki Nishitoh, Tatsuo Nakayama, Tatsuo Fukagawa, Yasunari Takami
平成２７年度日本生化学会九州支部会 (九州大学箱崎 キャンパス) 日本生化学会九州支部
開催年月日： 2015年5月16日
記述言語：日本語
開催地：九州大学箱崎 キャンパス
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Protective role of Naa60, a cellular acetyltransferase, in chemically induced DN A damage
Pasjan Satrima Fitrah, Hideki Nishitoh, Yasunari Takami
第37回日本分子生物学会年会 (パシフィコ横浜) 日本分子生物学会
開催年月日： 2014年11月25日 - 2014年11月27日
記述言語：英語 会議種別：ポスター発表
開催地：パシフィコ横浜
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The biological function of the WD40 repeat-containing protein RbAp48 in DT40 cells
Yasunari Takami, Pasjan S Fitrah, Tatsuo Nakayama, Hideki Nishitoh
第36回日本分子生物学会 (兵庫県神戸市神戸ポートピアホテル) 日本分子生物学会
開催年月日： 2013年12月3日 - 2013年12月6日
記述言語：日本語 会議種別：ポスター発表
開催地：兵庫県神戸市神戸ポートピアホテル
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ヒストンシャペロンRbAp48はCAF-1活性と可溶性H3-H4複合体の動態を制御する
高見恭成, Pasjan Satrima Fitrah, 西頭英起
第37回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム (長崎県雲仙市) 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
開催年月日： 2013年9月26日 - 2013年9月28日
記述言語：日本語 会議種別：ポスター発表
開催地：長崎県雲仙市
科研費（文科省・学振・厚労省）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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ゲノム改変細胞を用いたコアヒストンの生理機能解析
研究課題/領域番号： 18K06186 2018年04月 - 2021年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
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ゲノム損傷応答修復機構におけるヒストン修飾とクロマチン制御因子の役割
研究課題/領域番号：26440007 2014年04月 - 2017年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
ゲノム損傷応答修復機構におけるヒストン修飾とクロマチン制御因子の役割
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DNA複製に共役したクロマチン形成機構と組換えー修復機構の関連
研究課題/領域番号：21570183 2009年04月 - 2012年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
DNA複製に共役したクロマチン形成機構と組換えー修復機構の関連
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自己免疫とRNA修飾:全身性エリテマトーデス発症の分子機構
研究課題/領域番号：20200070 2009年04月 - 2010年03月
科学研究費補助金 特定領域研究
担当区分：研究分担者
タンパク質に翻訳されないノンコーディングRNA(ncRNA)が、生体内に多数存在する。これらのRNAは種々の修飾を受けているが、その意義は不明である。一方、全身性エリテマトーデス(SLE)患者の血清からリボソームRNAに対する抗体が多数見つかっている。なぜこのような抗体ができるのかは明らかではない。私たちは、RNA修飾の有無が免疫活性化の原因になるのではないかと考えた。これを明らかにするために、修飾欠損モデルを作製し、生体システムにおけるRNA修飾の役割を分子レベルで解析した。
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ゲノム損傷応答修復機構におけるクロマチン制御因子の役割
研究課題/領域番号：20055016 2008年04月 - 2010年03月
科学研究費補助金 特定領域研究
担当区分：研究代表者
ゲノム損傷応答修復機構におけるクロマチン制御因子の役割