|
所属 |
工学教育研究部 工学科応用物質化学プログラム担当 |
|
職名 |
准教授 |
|
外部リンク |
|
論文 【 表示 ／ 非表示 】
-
Evolution of genetic architecture and gene regulation in biphenyl/PCB-degrading bacteria 査読あり
Hidehiko Fujihara, Jun Hirose, Hikaru Suenaga
Frontiers in Microbiolog 14 1168246 - 1168246 2023年6月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
-
Jun Hirose
Microorganisms 11 ( 2 ) 438 2023年2月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Microorganisms
Integrative and conjugative elements (ICEs) are mobile DNA molecules that can be transferred through excision, conjugation, and integration into chromosomes. They contribute to the horizontal transfer of genomic islands across bacterial species. ICEs carrying genes encoding aromatic compound degradation pathways are of interest because of their contribution to environmental remediation. Recent advances in DNA sequencing technology have increased the number of newly discovered ICEs in bacterial genomes and have enabled comparative analysis of their evolution. The two different families of ICEs carry various aromatic compound degradation pathway genes. ICEclc and its related ICEs contain a number of members with diverse catabolic capabilities. In addition, the Tn4371 family, which includes ICEs that carry the chlorinated biphenyl catabolic pathway, has been identified. It is apparent that they underwent evolution through the acquisition, deletion, or exchange of modules to adapt to an environmental niche. ICEs have the property of both stability and mobility in the chromosome. Perspectives on the use of ICEs in environmental remediation are also discussed.
-
Study on arsenic methylation properties of Cellulomonas sp. K31 査読あり
Munetoshi Miyatake, Jun Hirose, Koichiro Shiomori, Haruhiko Yokoi
Resources Processing 68 ( 3 ) 117 - 123 2022年2月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
-
A new ICEclc subfamily integrative and conjugative element responsible for horizontal transfer of biphenyl and salicylic acid catabolic pathway in the PCB-degrading strain Pseudomonas stutzeri KF716 査読あり
Jun Hirose, Takahito Watanabe, Taiki Futagami, Hidehiko Fujihara, Nobutada Kimura, Hikaru Suenaga, Masatoshi Goto, Akiko Suyama and Kensuke Furukawa
Microorganisms 9 ( 12 ) 2462 2021年11月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
-
Study on Arsenic Methyltransferase Expressed in Recombinant E. coli 査読あり
Munetoshi Miyatake, Koshiro Takase, Jun Hirose, Koichiro Shiomori, Haruhiko Yokoi
Resources Processing 67 ( 2 ) 80 - 85 2020年12月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
-
Evolution of genetic architecture and gene regulation in biphenyl/PCB-degrading bacteria 査読あり
Fujihara H., Hirose J., Suenaga H.
Frontiers in Microbiology 14 2023年
掲載種別：速報，短報，研究ノート等（学術雑誌） 出版者・発行元：Frontiers in Microbiology
A variety of bacteria in the environment can utilize xenobiotic compounds as a source of carbon and energy. The bacterial strains degrading xenobiotics are suitable models to investigate the adaptation and evolutionary processes of bacteria because they appear to have emerged relatively soon after the release of these compounds into the natural environment. Analyses of bacterial genome sequences indicate that horizontal gene transfer (HGT) is the most important contributor to the bacterial evolution of genetic architecture. Further, host bacteria that can use energy effectively by controlling the expression of organized gene clusters involved in xenobiotic degradation will have a survival advantage in harsh xenobiotic-rich environments. In this review, we summarize the current understanding of evolutionary mechanisms operative in bacteria, with a focus on biphenyl/PCB-degrading bacteria. We then discuss metagenomic approaches that are useful for such investigation.
-
どこまで改造できるのか？タンパク質は
廣瀬 遵
生物工学会誌 85 ( 10 ) 453 2007年10月
記述言語：日本語 掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（全国大会，その他学術会議） 出版者・発行元：日本生物工学会
-
Properties of a new spore-bound enzyme from traditional Japanese fermentation food ‘natto’
Jun Hirose
Proceedings of the Commemorative International Symposium for 70th Aniversary of Sunchon National University 2005年5月
記述言語：英語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（大学・研究所紀要） 出版者・発行元：Sunchon National University
-
有用微細藻類のスクリーニングと分離株の諸特性
共著者：廣瀬 遵、横井春比古
都市エリア産学官連携促進事業【都城盆地エリア】「バイオマスの高度徹底活用による環境調和型産業の創出」第１年度成果報告書、56-58頁 2005年4月
記述言語：英語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他） 出版者・発行元：宮崎県産業支援財団
-
Microbial degradation of polychlorinated biphenyls (PCBs): biochemical and genetic bases
共著者：K.Furukawa, H.Suenaga, T.Watanabe, H.Fujiwara, J.Hirose
Molecular Genetics of Marine Organisms (Recent Advances in Marine Biotechnology, Vol. 10) Ed. by M. Fingerman and R. Nagabhushanam, 197-220 2004年1月
記述言語：英語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア） 出版者・発行元：Science Publishers Ltd. Enfield (NH), USA
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
-
Pseudomonas属細菌由来の環境浄化に寄与する染色体組み込み型接合因子(ICEs)のデータベースからの探索
廣瀬 遵、上原 由楓、藤波 寛人
日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
開催年月日： 2024年3月24日 - 2024年3月27日
記述言語：日本語 会議種別：口頭発表（一般）
-
細菌のα-トルイル酸誘導体代謝経路をコードする遺伝子群の構造および進化
Pseudomonas sp. LLC-1株による-トルイル酸およびその誘導体の分解経路をコードする遺伝子群の機能解析
日本生物工学会九州支部 第29回福岡大会 2023年12月3日
開催年月日： 2023年12月3日
記述言語：日本語 会議種別：口頭発表（一般）
-
遺伝子組換え大腸菌による 塩素化芳香族カルボン酸の分解
荒木愛斗、佐藤未唯、松本朋子、廣瀬 遵
第23回分析講演会 2023年9月22日
開催年月日： 2023年9月22日
会議種別：口頭発表（一般）
-
細菌のα-トルイル酸誘導体代謝経路をコードする遺伝子群の構造および進化
廣瀬 遵
第45回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム 2023年9月7日
開催年月日： 2023年9月7日
記述言語：日本語 会議種別：ポスター発表
-
Pseudomonas属細菌由来の環境浄化に寄与する染色体組み込み型可動性遺伝因子(ICE)のin silico解析
藤波寛人 上原由楓 廣瀬 遵
九州微生物研究フォーラム2023 2023年9月1日
開催年月日： 2023年9月1日 - 2023年9月2日
記述言語：日本語 会議種別：ポスター発表
受賞 【 表示 ／ 非表示 】
-
15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012) Organizing Committee Poster Award
2012年9月 IBS2012 Organizing Committee
Jun Hirose
受賞区分：国際学会・会議・シンポジウム等の賞 受賞国：大韓民国
科研費（文科省・学振・厚労省）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
-
芳香環酸素添加酵素の機能改変とコンビナトリアルケミストリーへの利用
2006年04月 - 2008年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
芳香環酸素添加酵素は、ベンゼン環などの芳香環に立体選択的に水 酸基を導入する酵素であり、本酵素が触媒する立体選択的な反応を利用することによ って化学合成が困難なモノ及びジヒドロキシ化合物の合成が可能である。本研究課題 では芳香環酸素添加酵素にランダムに変異を導入した変異酵素ライブラリーの中から、基質特異性及び反応特異性が野生型酵素とは異なる変異型酵素の取得を試みるとともに、新たに酵素に変異を導入することによって本酵素の基質特異性及び反応特性の改変を試みる。
-
発酵法による木質系バイオマスからの高濃度燃料エタノール生産
2006年04月 - 2008年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
組み換え大腸菌とエタノール耐性酵母の組み合わせにより、木質系バイマスから燃料エタノールを高濃度に生産する発酵システムの構築を試みる。
その他競争的資金獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
-
芳香環酸素添加酵素を利用したバイオマス資源の高機能化法の開発
2008年07月 - 2009年03月
その他省庁等 地域イノベーション創出総合支援事業重点地域研究開発推進プログラム平成20年度「シーズ発掘試験」
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
地球温暖化問題や原油価格の高騰に伴ってバイオマス資源のエネルギーや化成原料としての利用が注目されている。本研究課題では、植物由来のバイオマスに含まれる二次代謝産物であるフェノール類、安息香酸及びその誘導体、芳香族アミンなどの芳香族化合物に生体触媒を作用させることにより、抗酸化機能または電子伝達機能を持った有用な非天然型のポリフェノール類を取得する方法を開発する。芳香環に位置選択的に水酸基を導入できる芳香環酸素添加酵素群を使用する。
-
芳香族バイオマスの高度利用化に関する研究
2010年04月 - 2011年03月
宮崎大学 平成２２年度戦略重点経費（研究戦略経費）
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
現在利用が進んでいない植物の二次代謝産物であるリグニンやポリフェノールなどの芳香族化合物系バイオマス（芳香族バイオマス）を利用可能な物質に変換することを試みる。
研究・技術シーズ 【 表示 ／ 非表示 】
-
微生物ゲノムの解析による芳香族化合物代謝経路の分子進化の解明
リグニンの化学・生物処理による変換および有効利用
ポリフェノールの酸化酵素による変換および高機能化技術相談に応じられる関連分野：発酵生産、汚染土壌の修復、微生物・植物の同定および系統解析、酵素利用
メッセージ：・「微生物」「酵素」に関するテーマであれば何でもご相談ください。