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所属 |
農学部 農学部門動植物資源生命科学領域 |
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職名 |
准教授 |
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研究室住所 |
農学部南棟6階 S617 |
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研究室電話番号 |
0985-58-7507 |
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ホームページ |
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外部リンク |
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関連SDGs |
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井口 純 (イグチ アツシ)
IGUCHI Atsushi
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学歴 【 表示 ／ 非表示 】
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神戸大学 自然科学研究科 生命科学専攻
- 2006年3月
国名：日本国
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神戸大学 自然科学研究科 応用動物学専攻
- 2003年3月
国名：日本国
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滋賀大学 教育学部 初等教員養成課程
- 2000年3月
国名：日本国
学内職務経歴 【 表示 ／ 非表示 】
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宮崎大学 旧組織 畜産草地科学科 准教授
2014年04月 - 継続中
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宮崎大学 ＩＲ推進機構 助教
2010年03月 - 2014年03月
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宮崎大学 フロンティア科学実験総合センター 研究員
2006年04月 - 2009年03月
所属学協会 【 表示 ／ 非表示 】
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日本獣医学会
2017年5月 - 現在
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日本臨床微生物学会
2011年10月 - 現在
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日本食品微生物学会
2010年4月 - 現在
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日本ゲノム微生物学会
2008年1月 - 現在
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日本細菌学会
2002年4月 - 現在
論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Elbastawesy A.M., Awasthi S.P., Hatanaka N., Hinenoya A., Iguchi A., Ombarak R.A., Deeb A.M.M., Yamasaki S.
International Dairy Journal 162 2025年3月
掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：International Dairy Journal
Milk and dairy products are popular in Egyptian diets, but their contamination with Escherichia coli, poses health risks. This study investigated the prevalence of potentially pathogenic and antimicrobial-resistant E. coli in raw milk and dairy products from Kafrelsheikh and Algarbia Governorates, Egypt. Two hundred ten samples including raw buffalo milk, goat milk, Domiati cheese, Domiati cheese with pepper, rayeb, and yogurt were analyzed. The prevalence of E. coli was 26.2%, with the highest occurrence in buffalo milk (68.0%) and the lowest in rayeb (7.5%). Based on ERIC-PCR, eighty-four non-clonal E. coli strains were selected and further characterized. Among tested virulence genes, adhesion genes such as lpfAO113 and ehaA, were the most prevalent. Toxin-encoding genes such as astA, cdt, cnf, and hlyA were also detected. The cytotoxic and hemolytic activity of cdt, cnf, and hylA carrying E. coli were confirmed on CHO cells and sheep blood agar, respectively. Twenty-three (27.4%) strains showed resistance to one or more antimicrobials, and 10 (11.9%) strains exhibited multidrug resistance (MDR). Among 12 antimicrobials tested resistance against ampicillin, streptomycin and tetracycline was the highest. Phylogenetic analysis and O-genotyping indicated clinically significant strains such as Og103, Og157 and OgGp9. Notably, two OgGp9 strains were OgGp9:Hg18 and phylogenetic group D, like those associated with a large diarrheal outbreak caused by milk consumption in Japan, in 2021. Interestingly, these two strains harbored a complete type 3 secretion system 2 locus (ETT2) and one of these strains was MDR. These findings indicate that these dairy products were contaminated with potentially pathogenic and multidrug-resistant E. coli. This is the first report to analyze E. coli contamination in Domiati cheese with pepper and detect OgGp9:Hg18 outbreak-associated strains with ETT2 and MDR in Egypt.
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下痢原性大腸菌食中毒事例におけるO血清群およびH型の遺伝子型判定PCR検査法の活用 査読あり
小田切 正昭, 加藤 直樹, 曽根 美紀, 土屋 彰彦, 近藤 貴英, 井口 純
日本食品微生物学会雑誌 41 ( 3 ) 119 - 123 2024年9月
記述言語：日本語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：日本食品微生物学会
Diarrheagenic <i>Escherichia coli</i> strains are mainly classified into the following five pathotypes; enteropathogenic <i>E. coli</i>, enterotoxigenic <i>E. coli</i>, enteroinvasive <i>E. coli</i>, enterohemorrhagic <i>E. coli</i> and enteroaggregative <i>E. coli</i>. <i>E. coli</i> strains of various pathotypes can be further classified by their serotypes combined by O-serogroup and H-type. Generally in Japan, the commercial O-antisera and H-antisera are used to serotype strains. These serotypes provide useful information in investigations of outbreaks and epidemiological studies. In May 2021, a large-scale food poisoning outbreak thought to be caused by <i>E. coli</i> occurred in Saitama City. Serotyping of 21 <i>E. coli</i> strains carrying virulence genes isolated from patients and an asymptomatic cooking worker was carried out using a commercially available kit, but most of the strains (57%) could not be serotyped. Therefore, in this study, we tried the multiplex PCR methods including <i>E. coli</i> O-genotyping PCR and <i>E. coli</i> H-genotyping PCR. As a result, only 5% of strains could not be determined their Og-types, and the main genotype in this case was found to be Og104:Hg4 (12/21 strains) carrying <i>astA</i>+<i>aggR</i> or <i>estA2</i>+<i>elt</i>+<i>astA</i>+<i>aggR</i>. In conclusion, we believe that Og-typing PCR and Hg-typing PCR are effective methods in investigating cases caused by pathogenic <i>E. coli</i> belonging to rare pathotypes.
DOI： 10.5803/jsfm.41.119
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Lee K., Iguchi A., Terano C., Hataya H., Isobe J., Seto K., Ishijima N., Akeda Y., Ohnishi M., Iyoda S.
Microbiology spectrum 12 ( 1 ) 2024年1月
掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Microbiology spectrum
IMPORTANCE: Hemolytic uremic syndrome (HUS) is a life-threatening disease caused by Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) infection. The treatment approaches for STEC-mediated typical HUS and atypical HUS differ, underscoring the importance of rapid and accurate diagnosis. However, specific detection methods for STECs other than major serogroups, such as O157, O26, and O111, are limited. This study focuses on the utility of PCR-based O-serotyping, serum agglutination tests utilizing antibodies against the identified Og type, and isolation techniques employing antibody-conjugated immunomagnetic beads for STEC isolation. By employing these methods, we successfully isolated a STEC strain of a minor serotype, O76:H7, from a HUS patient.
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Iguchi A., Takemura T., Ogura Y., Nguyen T.T.H., Kikuchi T., Okuno M., Tokizawa A., Iwashita H., Pham H.Q.A., Doan T.H., Tran N.L., Tran T.L., Nguyen T.H., Tran T.H., Pham T.N.L., Dao T.D., Vu T.M.H., Nguyen T.N., Vu H., Nguyen V.T., Vu T.T.H., Le T.H., Lai T.A., Ngo T.C., Hasebe F., Nguyen D.T., Yamashiro T.
PLoS Neglected Tropical Diseases 17 ( 4 ) 2023年4月
掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：PLoS Neglected Tropical Diseases
Background Diarrheagenic Escherichia coli (DEC) is a group of bacterial pathogens that causes life-threatening diarrhea in children in developing countries. However, there is limited information on the characteristics of DEC isolated from patients in these countries. A detailed genomic analysis of 61 DEC-like isolates from infants with diarrhea was performed to clarify and share the characteristics of DEC prevalent in Vietnam. Principal findings DEC was classified into 57 strains, including 33 enteroaggregative E. coli (EAEC) (54.1%), 20 enteropathogenic E. coli (EPEC) (32.8%), two enteroinvasive E. coli (EIEC) (3.3%), one enterotoxigenic E. coli (ETEC), and one ETEC/EIEC hybrid (1.6% each), and surprisingly into four Escherichia albertii strains (6.6%). Furthermore, several epidemic DEC clones showed an uncommon combination of pathotypes and serotypes, such as EAEC Og130: Hg27, EAEC OgGp9:Hg18, EAEC OgX13:H27, EPEC OgGp7:Hg16, and E. albertii EAOg1:HgUT. Genomic analysis also revealed the presence of various genes and mutations associated with antibiotic resistance in many isolates. Strains that demonstrate potential resistance to ciprofloxacin and ceftriaxone, drugs recommended for treating childhood diarrhea, accounted for 65.6% and 41%, respectively. Significance Our finding indicate that the routine use of these antibiotics has selected resistant DECs, resulting in a situation where these drugs do not provide in therapeutic effects for some patients. Bridging this gap requires continuous investigations and information sharing regarding the type and distribution of endemic DEC and E. albertii and their antibiotic resistance in different countries.
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Suzuki Y., Shimizu H., Tamai S., Hoshiko Y., Maeda T., Nukazawa K., Iguchi A., Masago Y., Ishii S.
Environmental Monitoring and Assessment 195 ( 2 ) 2023年2月
掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Environmental Monitoring and Assessment
Waterborne diseases due to pathogen contamination in water are a serious problem all over the world. Accurate and simultaneous detection of pathogens in water is important to protect public health. In this study, we developed a method to simultaneously detect various pathogenic Escherichia coli by sequencing the amplicons of multiplex PCR. Our newly designed multiplex PCR amplified five genes for pathogenic E. coli (uidA, stx1, stx2, STh gene, and LT gene). Additional two PCR assays (for aggR and eae) were also designed and included in the amplicon sequencing analysis. The same assays were also used for digital PCR (dPCR). Strong positive correlations were observed between the sequence read count and the dPCR results for most of the genes targeted, suggesting that our multiplex PCR-amplicon sequencing approach could provide quantitative information. The method was also successfully applied to monitor the level of pathogenic E. coli in river water and wastewater samples. The approach shown here could be expanded by targeting genes for other pathogens.
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
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大腸菌血清型別の"これまで"と"これから" 招待あり 査読あり
井口純
家畜感染症学会誌 12 ( 3 ) 73 - 84 2023年7月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
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腸管出血性大腸菌（EHEC）検査・診断マニュアル 2022年10月改訂 招待あり
原田哲也、井口純、勢戸和子、伊豫田淳
国立感染症研究所 病原体検出マニュアル 2022年10月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他） 出版者・発行元：国立感染症研究所
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Le P.Q., Awasthi S.P., Hatanaka N., Hinenoya A., Hassan J., Ombarak R.A., Iguchi A., Tran N.T.T., Dao K.V.T., Vien M.Q., Le H.X., Do H.T., Yamamoto Y., Yamasaki S.
International Journal of Food Microbiology 370 2022年6月
掲載種別：速報，短報，研究ノート等（学術雑誌） 出版者・発行元：International Journal of Food Microbiology
The authors regret that the second affiliation of the sixth author was incorrectly written. The correct affiliation is Faculty of Veterinary Medicine, University of Sadat City, Sadat City, Egypt, as provided above. The authors would like to apologise for any inconvenience caused.
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腸管出血性大腸菌（EHEC）検査・診断マニュアル 2021年9月改訂 招待あり
原田哲也、井口純、勢戸和子、伊豫田淳
国立感染症研究所 病原体検出マニュアル 2021年9月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他） 出版者・発行元：国立感染症研究所
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大腸菌の血清型別PCR法・続報（非定型O血清群の分類） 招待あり 査読あり
井口純
国立感染症研究所 病原微生物検出情報 42 94 - 95 2021年5月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（大学・研究所紀要） 出版者・発行元：国立感染症研究所
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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ベトナムにおける下痢症起因細菌のフィールド研究
井口純
長崎大学熱帯医学研究共同拠点成果報告 2024年11月28日
開催年月日： 2024年11月28日
記述言語：日本語 会議種別：口頭発表（一般）
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Mannheimia haemolyticaの全血清型別PCR法の開発と実用性評価
井口純、福守調実、上村涼子、奥野未来、小椋義俊、星野尾歌織、上野勇一 、高松大輔
第167回日本獣医学会学術集会 2024年9月10日
開催年月日： 2024年9月10日 - 2024年9月11日
会議種別：口頭発表（一般）
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ウシ消化管内における大腸菌の空間的分布と多様性
井口純
第 20 回 21 世紀大腸菌研究会 2024年6月17日
開催年月日： 2024年6月17日 - 2024年6月18日
会議種別：ポスター発表
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E. coli Og-typing PCRによる便培養液中の大腸菌構成解析
岩田 佳音、伊豫田 淳、井口 純
第44回日本食品微生物学会学術総会 2023年9月21日
開催年月日： 2023年9月21日 - 2023年9月22日
会議種別：口頭発表（一般）
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ニホンジカやキョンなどの野生動物が保有する病原性大腸菌の調査
中塚 瑞涼、加藤 結子、伊豫田 淳、井口 純
第44回日本食品微生物学会学術総会 2023年9月21日
開催年月日： 2023年9月21日 - 2023年9月22日
会議種別：口頭発表（一般）
産業財産権 【 表示 ／ 非表示 】
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大腸菌非定型O血清群のO抗原コード遺伝子を標的としたPCR分類法
井口 純,加藤 結子
出願人：宮崎大学
出願番号：2021-106157 出願日：2021年6月25日
公開番号：特開2023-004478 公開日：2023年1月17日
出願国：国内
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PCR法を用いた赤痢菌の広域O血清群判定方法
井口 純, 西井 啓修
出願人：宮崎大学
出願番号：2021-501840 出願日：2020年2月5日
公開番号：WO2020/170823 公開日：2020年8月27日
特許番号/登録番号：7479640 登録日：2024年4月26日
出願国：国内 , 特許協力条約より出願 取得国：国内
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PCR法を用いた大腸菌の広域鞭毛抗原型判定方法
井口純, 番上将也
出願人：国立大学法人宮崎大学
出願番号：PCT/JP2017/25817 出願日：2017年7月14日
公開番号：WO2018/016451 公開日：2018年1月25日
出願国：国内
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PCR法を用いた大腸菌の広域O血清群判定方法
井口 純
出願人：宮崎大学
出願番号：2015-508754 出願日：2014年3月28日
公開番号：WO2014/157611 公開日：2014年10月2日
特許番号/登録番号：6500773 登録日：2019年3月29日
出願国：国内
受賞 【 表示 ／ 非表示 】
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宮崎大学ハイステップ表彰
2025年3月 宮崎大学 Genome evolution and plasticity of serratia marcescens, an important multidrugresistant nosocomial pathogen
井口 純
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地域貢献活動表彰・優秀賞
2024年12月 宮崎大学農学部 食中毒の予防と制御に資する国内外での検査・研究支援と啓蒙活動
井口 純
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宮崎大学ハイステップ表彰
2024年3月 宮崎大学
井口純
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令和3度宮崎大学農学部論文表彰 最優秀論文賞
2021年9月 宮崎大学農学部 Additional Og-Typing PCR Techniques Targeting Escherichia coli-Novel and Shigella-Unique O-Antigen Biosynthesis Gene Clusters
井口純
受賞国：日本国
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平成30年度宮崎大学農学部論文表彰 最優秀論文賞
2018年12月 宮崎大学農学部 Escherichia coli H-Genotyping PCR: a Complete and Practical Platform for Molecular H Typing
井口純
受賞国：日本国
科研費（文科省・学振・厚労省）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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ウシ消化管内で共生するヒト病原細菌の空間・生態的特徴の解明と新たな防除法の構築
研究課題/領域番号：23K27059 2023年04月 - 2026年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費基金 基盤研究(B)
担当区分：研究代表者
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ウシ消化管内で共生するヒト病原細菌の空間・生態的特徴の解明と新たな防除法の構築
研究課題/領域番号：23H02366 2023年04月 - 2026年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究(B)
担当区分：研究代表者
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カンピロバクター食中毒の発生に寄与する二次汚染要因の探索
研究課題/領域番号：16K00941 2016年04月 - 2019年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
カンピロバクター食中毒の発生に寄与する二次汚染要因の探索
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大腸菌抗原変化のメカニズム解明と多様化した糖鎖抗原の機能について
研究課題/領域番号：16K08780 2016年04月 - 2019年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
大腸菌の菌体表層には糖鎖抗原（O抗原）が発現しており、その抗原性の種類は180を超えている。本研究ではO抗原の多様性に注目し、①抗原変化の遺伝学的な組換えメカニズムを解明する。さらに②多様化した糖鎖構造の宿主に対する機能性（生存性や病原性）を検証する。
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リステリアの食品製造施設への定着要因を探る
研究課題/領域番号：25350180 2013年04月 - 2016年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
Listeria monocytogenes（リステリア）は、食品を介して髄膜炎や敗血症などの重篤な感染症を引き起こす。本菌は食品製造施設に定着し、製造・加工工程で食品を汚染することが示されており、分離株の分子疫学解析によって施設定着株の存在を認める報告が多数みられる。しかしながら、これら定着株に特有の属性はいまだ不明である。本研究は、施設および食品由来リステリア株に新規遺伝子型別法を適用し、リステリアの施設定着に関連する遺伝系統を明らかにする。また、先に分離した高バイオフィルム形成性の定着株を中心に、これらの菌株が形成するバイオフィルムの性状と構成多糖の解析ならびに自由生活性アメーバに対する本菌の捕食抵抗性を比べて、施設定着株が有する属性とその遺伝系統を明らかにし、食品衛生に資することを目的とする。
その他競争的資金獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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ベトナムにおける下痢症起因細菌のフィールド研究
2025年04月 - 2026年03月
長崎大学 令和7年度長崎大学熱帯医学研究拠点 海外拠点連携共同研究
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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ベトナムにおける下痢症起因細菌のフィールド研究
2024年04月 - 2025年03月
長崎大学 令和6年度長崎大学熱帯医学研究拠点 海外拠点連携共同研究
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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ベトナムにおける下痢症起因細菌のフィールド研究
2023年04月 - 2024年03月
長崎大学 令和5年度長崎大学熱帯医学研究拠点 海外拠点連携共同研究
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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大腸菌LPS-O抗原糖鎖の多様性と生物学的役割の解明
2023年04月 - 2024年03月
大分大学 令和5年度大分大学グローカル感染症研究センター 共同研究課題
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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大腸菌LPS-O抗原糖鎖の多様性と生物学的役割の解明
2022年07月 - 2023年03月
大分大学 令和4年度大分大学グローカル感染症研究センター 共同研究課題
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
共同研究実施実績 【 表示 ／ 非表示 】
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腸内微生物のゲノム・菌叢解析
2024年10月 - 2029年03月
国立大学法人東京大学 国内共同研究
担当区分：研究代表者 共同研究区分：国内共同研究
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腸管出血性大腸菌等における血清型判定PCR 法の実用性評価
2023年08月 - 2024年03月
株式会社中部衛生検査センター 国内共同研究
担当区分：研究代表者 共同研究区分：国内共同研究
寄附金・講座・研究部門 【 表示 ／ 非表示 】
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成果有体物（PCRプライマーセット）の有償分与
寄附者名称：福岡保健環境研究所 2020年02月
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成果有体物（PCRプライマーセット）の有償分与
寄附者名称：鳥取 倉吉家畜保健研究所 2020年02月
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成果有体物（PCRプライマーセット）の有償分与
寄附者名称：国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 2020年02月
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成果有体物（PCRプライマーセット）の有償分与
寄附者名称：新潟県保健環境科学研究所 2020年01月
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成果有体物（PCRプライマーセット）の有償分与
寄附者名称：東京女子医科大学 2020年01月
研究・技術シーズ 【 表示 ／ 非表示 】
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家畜・家禽・野生動物から分離される細菌の研究
細菌のゲノム解析とその情報を用いた新規検査法の開発
衛生教育に使用する教材等の作製技術相談に応じられる関連分野：細菌学、ゲノム科学
メッセージ：研究内容やこれまでの業績などの詳細は、研究室HPでご確認ください
委員歴 【 表示 ／ 非表示 】
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腸管出血性大腸菌研究会 運営委員
2024年4月 - 現在
団体区分：学協会
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家畜感染症学会 評議員
2024年4月 - 現在
団体区分：学協会
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日本食品微生物学会 評議員
2020年1月 - 現在
団体区分：学協会
社会貢献活動 【 表示 ／ 非表示 】
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CADIC特別セミナー「Treasure every meeting〜アフリカで繋がった感染症研究、そしてベトナムのコウモリ由来感染症フィールド調査〜」
役割：司会, 企画
2025年2月28日
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第3回下痢原性大腸菌等遺伝子検査法講習会
役割：講師
宮崎大学農学部 2024年8月22日 - 2024年8月23日
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第2回下痢原性大腸菌等遺伝子検査法講習会
役割：講師
宮崎大学農学部 2024年7月11日 - 2024年7月12日
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宮崎県立高鍋農業高校・農業クラブ活動の指導（菌床焼却灰の殺菌効果の検証）
役割：助言･指導
2024年6月5日 - 2024年10月10日
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CADIC特別セミナー「グローバルヘルスの課題解決に挑む」
役割：司会, 企画
2023年11月30日