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医学部 医学科 機能制御学講座生命分子科学分野 |
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関連SDGs |
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論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Wang S., Saneyoshi H., Xu P., Oguri N., Yamashita A., Xu Y.
Nucleic Acids Research 53 ( 12 ) 2025年7月
担当区分：最終著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Nucleic Acids Research
Effectively controlling the structures of DNA and RNA is crucial for their functional utilization in material development, biological regulation, and medical applications. Here, we present a gain-of-function strategy for controlling DNA and RNA structures using an inverse electron-demand Diels-Alder (IEDDA) based click-to-release reaction. By incorporating click reaction-cleavable caged moiety into oligonucleotides, we disrupt activated base pairs, allowing controlled release of biofunctional higher-order nucleic acid structures. This click-to-release caged DNA was employed to control DNA duplex formation. Next, we demonstrated the utility of "click-to-release"strategy for regulated release of Z-DNA or Z-RNA and bind associated proteins. In addition, the approach was used to manipulated G-quadruplex formation in vitro and in vivo, enabling visual detection of G-quadruplex using BVE-caged DNA with fluorescent dye. Furthermore, we demonstrated the utility of click-to-release caged DNA for Quantum Dots (QDs) functionalization, enabling precise molecular imaging for cancer diagnosis. Finally, we developed a click-to-release controllable nucleic acid aptamer for precise blood clotting regulation and anticoagulation therapy. This strategy provides moderate kinetics, excellent orthogonality, and biocompatibility. It establishes a new pathway towards control of nucleic acid structures and functions, which has promising applications in various biological procedures and nucleic acid medicines.
DOI： 10.1093/nar/gkaf571
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Z-form DNA-RNA hybrid blocks DNA replication 査読あり 国際共著 国際誌
Shiyu Wang, Yan Xu
Nucleic Acids Research 53 ( 5 ) 2025年3月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1093/nar/gkaf135
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Effects of Fluorine Substitution on the Human Telomeric RNA G-Quadruplex Structure 査読あり 国際誌
Saneyoshi H., Ishizuka T., Wang S., Iwakiri R., Xu Y.
Chemistry A European Journal 31 ( 39 ) 2025年7月
担当区分：最終著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌） 出版者・発行元：Chemistry A European Journal
DNA G-quadruplex structures can adopt different topologies, whereas RNA G4 predominantly forms parallel-type structures. While previous studies have reported the stabilization of DNA G-quadruplex topologies using syn-favored nucleosides, stabilization of parallel-type RNA G-quadruplexes through chemical modification remains unachieved. Here, we demonstrate that substitution with 2′-deoxy-2′-fluoroarabinoguanosine (2′F-araG) at specific positions in the human telomeric RNA sequence stabilizes the parallel-type G-quadruplex structure. This stabilization arises from electrostatic interactions via pseudo hydrogen bonds, induced by the 2′F-araG modification.
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Mirror-Image RNA: A Right-Handed Z-Form RNA and Its Ligand Complex 査読あり
Yi Song, Shiyu Wang and Yan Xu*
Molecules 29 ( 20 ) 2024年10月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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In Cell 19F NMR for Non-Canonical Structures 招待あり 査読あり 国際誌
Yan Xu
XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 2024年9月
担当区分：筆頭著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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Oligonucleotide Containing 8-Trifluoromethyl-2′-Deoxyguanosine as a Z-DNA Probe (Z-DNA) 国際共著
Hong-Liang Bao & Yan Xu（ 担当： 分担執筆）
Methods in Molecular Biology 2023年3月 （ ISBN:978-4065207864 ）
記述言語：英語 著書種別：学術書
Z-DNA structure is a noncanonical left-handed alternative form of DNA, which has been suggested to be biologically important and is related to several genetic diseases and cancer. Therefore, investigation of Z-DNA structure associated with biological events is of great importance to understanding the functions of these molecules. Here, we described the development of a trifluoromethyl labeled deoxyguanosine derivative and employed it as a 19F NMR probe to study Z-form DNA structure in vitro and in living cells.
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In Cell 19F NMR for G-quadruplex (Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids) 国際共著
Yan Xu（ 担当： 分担執筆）
Springer, Singapore 2023年1月 （ ISBN:978-981-16-1313-5 ）
記述言語：英語 著書種別：学術書
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核酸科学ハンドブック(第II部 核酸科学の最前線 3. グアニン四重鎖構造)
徐岩（ 担当： 分担執筆 , 範囲: 第II部 核酸科学の最前線 3. グアニン四重鎖構造）
講談社 2020年12月 （ ISBN:978-4065207864 ）
総ページ数：576 記述言語：日本語 著書種別：学術書
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T. Ishizuka, H. L. Bao, Y. Xu*（ 担当： 共著）
Springer 2019年8月
総ページ数：pp 407-433 記述言語：英語 著書種別：学術書
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Clipping of Telomere from Human Chromosomes Using a Chemistry-Based Artificial Restriction DNA Cutter（共著）
Takumi Ishizuka, Yan Xu, Makoto Komiyama（ 担当： 共著）
John Wiley & Sons, Inc. 2015年6月
記述言語：英語
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
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ヒトテロメアDNA/RNA４重鎖構造及びそれを活用した新規癌標的治療法の開発 招待あり
徐岩
細胞 2020年4月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
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Human Telomere RNA Structure and Function 査読あり
Y. Xu
Telomere and Telomerase 3 2016年11月
記述言語：英語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
DOI： 10.14800/tt.1455
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化学の目で、ヒトテロメアの謎を解く(共著)
徐岩
日本化学会生体関連部会ニュースレター 26 ( 1 ) 3 - 6 2011年6月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他） 出版者・発行元：日本化学会
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G-カルテット安定化分子でテロメラーゼを阻害する
Shinohara,K., Xu,Y., Sugiyama,H
化学 60 ( 7 ) 68 - 69 2005年7月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌） 出版者・発行元：化学同人
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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A click-to-release strategy in nucleic acids: manipulating DNA and RNA structures for biological and biomedical applications 国際会議
Shiyu Wang, Hisao Saneyoshi, Yan Xu
第52回国際核酸化学シンポジウム 2025年11月12日
開催年月日： 2025年11月12日 - 2025年11月14日
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）
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Solution structure of Z-form DNA bound to acuraxin ligand CBL0137 国際会議
Feifan Liu, Shiyu Wang, Yan Xu
第52回国際核酸化学シンポジウム 2025年11月12日
開催年月日： 2025年11月12日 - 2025年11月14日
記述言語：英語 会議種別：ポスター発表
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Visualization of G-quadruplexes in animals and tissues 国際会議
Meng-Hao Jia, Yan Xu
第52回国際核酸化学シンポジウム 2025年11月13日
開催年月日： 2025年11月12日 - 2025年11月14日
記述言語：英語 会議種別：ポスター発表
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Fluorinated G-quadruplex RNA for Highly Sensitive Photodynamic Diagnosis 国際会議
Rie Iwakiri, Shiyu Wang, Takashi Okazoe, Mihoko Noro, Yan Xu
第52回国際核酸化学シンポジウム 2025年11月12日
開催年月日： 2025年11月12日 - 2025年11月14日
記述言語：英語 会議種別：ポスター発表
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3-Cyano-3-Deazaguanosine: Synthesis and Structural Basis for RNA Stabilization 国際会議
Hisao Saneyoshi, Shiyu Wang, Yan Xu
第52回国際核酸化学シンポジウム 2025年11月13日
開催年月日： 2025年11月12日 - 2025年11月14日
記述言語：英語 会議種別：ポスター発表
受賞 【 表示 ／ 非表示 】
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宮崎大学ハイステップ研究者
2019年2月 宮崎大学
徐岩
受賞区分：国内外の国際的学術賞 受賞国：日本国
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光科学技術研究振興財団研究奨励金
2018年2月 光科学技術研究振興財団
徐岩
受賞区分：出版社・新聞社・財団等の賞 受賞国：日本国
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宮崎大学ハイステップ研究者
2016年12月 宮崎大学
徐岩
受賞国：日本国
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武田科学振興財団研究奨励金
2013年8月 武田科学振興財団
徐岩
受賞区分：出版社・新聞社・財団等の賞 受賞国：日本国
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内藤記念科学振興財団研究奨励金
2011年12月 内藤記念科学振興財団
徐岩
受賞区分：出版社・新聞社・財団等の賞 受賞国：日本国
科研費（文科省・学振・厚労省）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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19F NMR分子技術の開発によるヒト細胞内DNA及びRNA高次構造の解明 国際共著
研究課題/領域番号：21H02081 2021年04月 - 2024年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究(B)
担当区分：研究代表者
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非標準型核酸の構造・機能及び蛋白質との相互作用の解明を目指したｹﾐｶﾙﾊﾞｲｵﾛｼﾞｰ
研究課題/領域番号：24K01648 2024年04月 - 2027年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費基金 基盤研究(B)
担当区分：研究代表者
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クリック反応技術と軸配位子糖鎖連結ポリフィリン錯体を融合した革新的PDTの開発
研究課題/領域番号：22K08806 2022年04月 - 2025年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究(C)
七島 篤志、
担当区分：研究分担者
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分子結合技術を用いた新たな造影剤による革新的がんMRI画像化技術の開発
研究課題/領域番号：20K08000 2020年04月 - 2023年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
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胆管癌の局所制御増強と光線過敏軽減による普及を目指した次世代光線力学的療法の開発
研究課題/領域番号：19K09178 2019年04月 - 2022年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
その他競争的資金獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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蛍光分子イメージングにより実現する革新的がん可視化画像診断技術の開発
2017年04月 - 2020年03月
国立研究開発法人日本医療研究開発機構 革新的がん医療実用化研究事業 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 革新的がん医療実用化研究事業
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
寄附金・講座・研究部門 【 表示 ／ 非表示 】
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機能制御学講座物質科学分野研究奨学金（2025年度武田科学振興財団）
寄附者名称：公益財団法人武田科学振興財団 2025年06月
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機能制御学講座物質科学分野研究奨学金（2025年度公益財団法人JKA）
寄附者名称：公益財団法人JKA 2025年04月
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機能制御学講座物質科学分野研究奨学金(光科学技術研究振興財団)
2019年02月
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機能制御学講座物質科学分野研究奨学金(光化学技術研究振興財団)
寄附者名称：光科学技術研究振興財団 2018年02月
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機能制御学講座物質科学分野研究奨学金(2015年度内藤記念科学振興財団)
寄附者名称：徐 岩 2017年04月
その他研究活動 【 表示 ／ 非表示 】
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Advisory Board of Sci
2018年01月 - 現在
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Editorial Board of Molecules
2017年04月 - 現在
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"Faculty of 1000"のメンバー
2008年04月 - 現在
"Faculty of 1000" とは、生物学と医学研究の出版物において、最も重要だと思われる論文を認定し評価を与える国際学術組織です。
研究・技術シーズ 【 表示 ／ 非表示 】
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生命分子機構を解明する革新的分子技術の開発
テロメアを標的とする革新的分子技術の開発
化学による革新的がん可視化診断技術の開発ホームページ： 医学部機能制御学講座生命分子科学分野
技術相談に応じられる関連分野：機能性核酸の創製、イメージング分子合成、細胞・動物分子イメージング、活性小分子の作製、短鎖ペプチドの合成
メッセージ：・共同研究の希望テーマ：細胞・動物分子イメージング、人工核酸医薬、がん診断・治療
授業 【 表示 ／ 非表示 】
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環境と生命
科目区分：共通教育科目
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有機化学
科目区分：共通教育科目
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Biotechnology III
科目区分：専門教育科目
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有機化学
科目区分：共通教育科目
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環境と生命
科目区分：共通教育科目