石塚 匠 (イシヅカ タクミ)

ISHIZUKA Takumi

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所属

医学部 医学科 解剖学講座組織細胞化学分野

職名

助教

外部リンク

関連SDGs


学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(工学) ( 2011年3月   東京大学 )

研究分野 【 表示 / 非表示

  • ナノテク・材料 / 生体化学

  • ナノテク・材料 / ケミカルバイオロジー

学歴 【 表示 / 非表示

  • 東京大学   工学系研究科   化学生命工学専攻

    - 2011年3月

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    国名:日本国

  • 東京工業大学   生命理工学部

    - 2006年3月

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    国名:日本国

 

論文 【 表示 / 非表示

  • Effects of Fluorine Substitution on the Human Telomeric RNA G-Quadruplex Structure 査読あり

    Saneyoshi H., Ishizuka T., Wang S., Iwakiri R., Xu Y.

    Chemistry A European Journal   31 ( 39 )   2025年7月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Chemistry A European Journal  

    DNA G-quadruplex structures can adopt different topologies, whereas RNA G4 predominantly forms parallel-type structures. While previous studies have reported the stabilization of DNA G-quadruplex topologies using syn-favored nucleosides, stabilization of parallel-type RNA G-quadruplexes through chemical modification remains unachieved. Here, we demonstrate that substitution with 2′-deoxy-2′-fluoroarabinoguanosine (2′F-araG) at specific positions in the human telomeric RNA sequence stabilizes the parallel-type G-quadruplex structure. This stabilization arises from electrostatic interactions via pseudo hydrogen bonds, induced by the 2′F-araG modification.

    DOI: 10.1002/chem.202501508

    Scopus

  • Non-Cytotoxic Photodynamic Therapy with Talaporfin Sodium Reduces the Expression of CXCR4 and Enhances Chemotherapeutic Efficacy in Undifferentiated Gastric Cancer Cell Line HGC27 査読あり

    Kai K, Ishizuka T, Matsumoto J, Shimamawari K, Mori R, Fidya, Lkham-Erdene B, Kubota T, Ikenoue M, Higuchi K, Nanashima A, Hishikawa Y

    Acta Histochemica et Cytochemica   58 ( 2 )   69 - 79   2025年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1267/ahc.25-00002

  • SETDB1-Mediated Chromatin Regulation in Intestinal Epithelial Cells During Intestinal Ischemia-Reperfusion Injury 査読あり

    Higuchi K, Ikenoue M, Ishizuka T, Kai K, Takahashi N, Kubota T, Shirouzu S, Lkham-Erdene B, Mo Aung K, Nakai M, Sawaguchi A, Nanashima A, Hishikawa Y

    Acta Histochemica et Cytochemica   58 ( 1 )   9 - 18   2025年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1267/ahc.24-00061

  • Effect of Hepatic Lipid Overload on Accelerated Hepatocyte Proliferation Promoted by HGF Expression via the SphK1/S1PR2 Pathway in MCD-diet Mouse Partial Hepatectomy 査読あり

    Lkham-Erdene B., Choijookhuu N., Kubota T., Uto T., Mitoma S., Shirouzu S., Ishizuka T., Kai K., Higuchi K., Aung K.M., Batmunkh J.E., Sato K., Hishikawa Y.

    Acta Histochemica et Cytochemica   57 ( 5 )   175 - 188   2024年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Acta Histochemica et Cytochemica  

    Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is becoming a major health problem worldwide. Liver regeneration is crucial for restoring liver function, and is regulated by extraordinary complex process, involving numerous factors under both physiologic and pathologic conditions. Sphingosine-1-phosphate (S1P), a bioactive sphingolipid synthesized by sphingosine kinase 1 (SphK1), plays an important role in liver function through S1P receptors (S1PRs)-expressing cells. In this study, we investigated the effect of lipid overload on hepatocyte proliferation in a mouse hepatic steatosis model induced by feeding a methionine-and choline-deficient (MCD) diet. After 50% partial hepatectomy (PHx), liver tissues were sampled at various timepoints and then analyzed by immunohistochemistry, oil Red-O staining, quantitative-polymerase chain reaction (qPCR), and flow cytometry. In mice fed the MCD-diet, significantly exacerbated hepatic steatosis and accelerated liver regeneration were observed. After PHx, hepatocyte proliferation peaked at 48 and 36 hr in the liver of chow-and MCD-diet fed mice, respectively. By contrast, increased expression of S1PR2 was observed in hepatic neutrophils and macrophages of MCD-diet fed mice. Flow cytome-try and qPCR experiments demonstrated that levels of HGF and FGF2 released by neutrophils and macrophages were significantly higher in MCD-diet fed mice. In conclusion, hepatic lipid overload recruits Kupffer cells and neutrophils that release HGF and FGF2 via SphK1/S1PR2 activation to accelerate hepatocyte proliferation.

    DOI: 10.1267/ahc.24-00046

    Scopus

    CiNii Research

  • The crucial role of SETDB1 in structural and functional transformation of epithelial cells during regeneration after intestinal ischemia reperfusion injury 査読あり

    Ikenoue M., Choijookhuu N., Yano K., Fidya , Takahashi N., Ishizuka T., Shirouzu S., Yamaguma Y., Kai K., Higuchi K., Sawaguchi A., Nanashima A., Hishikawa Y.

    Histochemistry and Cell Biology   161 ( 4 )   325 - 336   2024年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Histochemistry and Cell Biology  

    Su (var) 3–9, enhancer of seste, trithorax (SET)-domain bifurcated histone lysine methyltransferase (SETDB1) plays a crucial role in maintaining intestinal stem cell homeostasis; however, its physiological function in epithelial injury is largely unknown. In this study, we investigated the role of SETDB1 in epithelial regeneration using an intestinal ischemia/reperfusion injury (IRI) mouse model. Jejunum tissues were sampled after 75 min of ischemia followed by 3, 24, and 48 h of reperfusion. Morphological evaluations were performed using light microscopy and electron microscopy, and the involvement of SETDB1 in epithelial remodeling was investigated by immunohistochemistry. Expression of SETDB1 was increased following 24 h of reperfusion and localized in not only the crypt bottom but also in the transit amplifying zone and part of the villi. Changes in cell lineage, repression of cell adhesion molecule expression, and decreased histone H3 methylation status were detected in the crypts at the same time. Electron microscopy also revealed aberrant alignment of crypt nuclei and fusion of adjacent villi. Furthermore, increased SETDB1 expression and epithelial remodeling were confirmed with loss of stem cells, suggesting SETDB1 affects epithelial cell plasticity. In addition, crypt elongation and increased numbers of Ki-67 positive cells indicated active cell proliferation after IRI; however, the expression of PCNA was decreased compared to sham mouse jejunum. These morphological changes and the aberrant expression of proliferation markers were prevented by sinefungin, a histone methyltransferase inhibitor. In summary, SETDB1 plays a crucial role in changes in the epithelial structure after IRI-induced stem cell loss.

    DOI: 10.1007/s00418-023-02263-9

    Scopus

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書籍等出版物 【 表示 / 非表示

  • In situ hybridization法

    菱川 善隆, 石塚 匠, 柴田 恭明, 小路 武彦( 担当: 共著)

    日本組織細胞化学会・中西印刷(株)  2025年7月 

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

  • In situ hybridization法

    菱川 善隆, 石塚 匠, 柴田 恭明, 小路 武彦( 担当: 共著)

    日本組織細胞化学会・中西印刷(株)  2024年7月 

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

  • 蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)現象を利用した 高感度in situ hybridization

    石塚 匠,Narantsog Choijookhuu,柴田 恭明,小路 武彦,菱川 善隆( 担当: 共著)

    日本顕微鏡学会  2023年12月 

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

  • In situ hybridization法

    菱川 善隆, Narantsog Choijookhuu, 石塚 匠, 柴田 恭明, 小路 武彦( 担当: 共著)

    日本組織細胞化学会・中西印刷(株)  2023年7月 

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

  • In situ hybridization法

    菱川 善隆, Narantsog Choijookhuu, 石塚 匠, 柴田 恭明, 小路 武彦( 担当: 共著)

    日本組織細胞化学会・中西印刷(株)  2022年7月 

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    記述言語:日本語 著書種別:学術書

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講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示

  • DNA G-quadruplex dynamics during liver regeneration after partial hepatectomy in mice 国際会議

    Takumi Ishizuka, Kham Mo Aung, Toshiki Kubota, Baljinnyam Lkham-Erdene, Kengo Kai, Phyu Synn Oo, Yoshitaka Hishikawa

    第52回国際核酸化学シンポジウム/日本核酸化学会第9回年会  (富山国際会議場)  2025年11月12日  日本核酸化学会

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    開催年月日: 2025年11月12日 - 2025年11月14日

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:富山国際会議場  

  • 蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を応用したモレキュラービーコンプローブによるin situ hybridization 招待あり

    Narantsog Choijookhuu,柴田 恭明,石塚 匠,徐 岩,小路 武彦,菱川 善隆

    第66回日本組織細胞化学会総会・学術集会  (大阪公立大学 I-siteなんば)  2025年10月25日 

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    開催年月日: 2025年10月25日 - 2025年10月26日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    開催地:大阪公立大学 I-siteなんば  

  • 超解像顕微鏡による生体分子蛍光イメージング解析 招待あり

    石塚 匠

    第66回日本組織細胞化学会総会・学術集会  (大阪公立大学 I-siteなんば)  2025年10月25日 

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    開催年月日: 2025年10月25日 - 2025年10月26日

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(指名)  

    開催地:大阪公立大学 I-siteなんば  

  • Biological role of DNA G-quadruplex during liver regeneration after partial hepatectomy 国際会議

    Takumi Ishizuka, Kham Mo Aung, Toshiki Kubota, Baljinnyam Lkham-Erdene, Kengo Kai, Yoshitaka Hishikawa

    17th international congress of histochemistry and cytochemistry  (Rimini, Italy) 

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    開催年月日: 2025年8月27日 - 2025年8月30日

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

    開催地:Rimini, Italy  

  • マウス精子形成過程におけるDNA四重鎖構造の発現動態

    石塚 匠, Kham Mo Aung, Baljinnyam Lkham-Erdene, 久保田 壽樹, 甲斐 健吾, 菱川 善隆

    第65回日本組織細胞化学会総会・学術集会  (群馬大学医学部)  2024年10月27日 

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    開催年月日: 2024年10月26日 - 2024年10月27日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:群馬大学医学部  

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受賞 【 表示 / 非表示

  • 日本組織細胞化学会 Paul K. Nakane AHC Award (Gold medal)

    2025年10月   日本組織細胞化学会  

    Narantsog Choijookhuu, Yasuaki Shibata, Takumi Ishizuka, Yan Xu, Takehiko Koji, Yoshitaka Hishikawa

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    受賞区分:国内外の国際的学術賞 

  • 日本組織細胞化学会 論文賞

    2023年10月   日本組織細胞化学会  

    Narantsog Choijookhuu, Yasuaki Shibata, Takumi Ishizuka, Yan Xu, Takehiko Koji, Yoshitaka Hishikawa

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    受賞区分:国内外の国際的学術賞 

  • FB3 優秀ポスター賞

    2012年7月   FB3 organizing committee  

    石塚匠

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    受賞区分:国際学会・会議・シンポジウム等の賞  受賞国:スウェーデン王国

  • 東京大学大学院工学系研究科長賞(修士)

    2008年3月   東京大学  

    石塚匠

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    受賞国:日本国

科研費(文科省・学振・厚労省)獲得実績 【 表示 / 非表示

  • 精子形成過程から解明するグアニン四重鎖構造の生物学的機能

    研究課題/領域番号:24K08641  2024年04月 - 2027年03月

    独立行政法人日本学術振興会  科学研究費基金  基盤研究(C)

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    担当区分:研究代表者 

  • PDP効果に基づく胃癌腹膜播種に対する簡便かつ安全な光治療の開発

    研究課題/領域番号:24K11937  2024年04月 - 2027年03月

    独立行政法人日本学術振興会  科学研究費基金  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者 

  • 細胞内RNA四重鎖を標的とする構造プローブ法の開発

    研究課題/領域番号:21K05314  2021年04月 - 2024年03月

    独立行政法人日本学術振興会  科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    担当区分:研究代表者 

  • 分子結合技術を用いた新たな造影剤による革新的がんMRI画像化技術の開発

    研究課題/領域番号:20K08000  2020年04月 - 2023年03月

    独立行政法人日本学術振興会  科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者 

  • 分子結合技術を用いた造影剤による革新的がんCT画像化技術の開発

    研究課題/領域番号:19K08156  2019年04月 - 2022年03月

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者 

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その他競争的資金獲得実績 【 表示 / 非表示

その他研究活動 【 表示 / 非表示

  • 第47回組織細胞化学講習会

    2022年08月

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    In situ hybridization法」の技術講習会Wet Labを行った。

 

社会貢献活動 【 表示 / 非表示

  • 解剖見学及び標本示説実習(鵬翔高等学校看護専攻科)

    役割:講師

    2023年2月1日 - 2023年2月2日

  • 解剖見学及び標本示説実習(九州保健福祉大学総合医療専門学校)

    役割:講師

    2023年1月31日

  • 解剖見学及び標本示説実習(宮崎リハビリテーション学院)

    役割:講師

    2023年1月23日

  • 解剖見学及び標本示説実習(小林看護医療専門学校)

    役割:講師

    2023年1月11日

  • 解剖見学及び標本示説実習(小林看護医療専門学校)

    役割:講師

    2022年9月2日

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授業 【 表示 / 非表示

  • 遺伝子工学の基礎と応用

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    科目区分:共通教育科目 

  • 遺伝子工学の基礎と応用

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    科目区分:共通教育科目