所属 |
地域資源創成学部 |
職名 |
特別助教 |
外部リンク |
学歴 【 表示 / 非表示 】
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宮崎大学 農学系研究科 生物機能応用科学専攻 博士課程
2011年4月 - 2014年3月
国名:日本国
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宮崎大学 農学研究科 応用生物科学専攻 修士課程
2009年4月 - 2011年3月
国名:日本国
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宮崎大学 農学部 応用生物科学科
2005年4月 - 2009年3月
国名:日本国
学内職務経歴 【 表示 / 非表示 】
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宮崎大学 地域資源創成学部 特別助教
2022年07月 - 継続中
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宮崎大学 地域資源創成学部 研究員
2022年04月 - 2022年06月
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宮崎大学 農学部 畜産草地科学科 研究員
2018年04月 - 2022年03月
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宮崎大学 農学部 応用生物科学科 研究員
2014年04月 - 2015年03月
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宮崎大学 農学工学総合研究科 生物機能応用科学専攻 日本学術振興会特別研究員
2012年04月 - 2014年03月
学外略歴 【 表示 / 非表示 】
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宮崎県総合農業試験場 研究員
2017年11月 - 2018年3月
国名:日本国
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エディットフォース株式会社 主任研究員
2017年2月 - 2017年10月
国名:日本国
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米国環境健康科学研究所(NIEHS/NIH) 客員研究員
2015年4月 - 2017年1月
国名:日本国
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米国環境健康科学研究所(NIEHS/NIH) 特別研究員
2014年4月 - 2015年3月
国名:日本国
所属学協会 【 表示 / 非表示 】
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日本育種学会
2019年6月 - 2022年1月
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内外環境応答・代謝酵素研究会(旧P450,UGT,SULT研究会)
2013年6月 - 現在
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日本フードファクター学会
2010年6月 - 2013年12月
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日本農芸化学会
2009年12月 - 現在
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日本プロテオーム学会
2009年12月 - 2014年1月
論文 【 表示 / 非表示 】
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Kurogi K., Sakakibara Y., Hashiguchi T., Kakuta Y., Kanekiyo M., Teramoto T., Fukushima T., Bamba T., Matsumoto J., Fukusaki E., Kataoka H., Suiko M.
PNAS Nexus 3 ( 3 ) pgae097 2024年3月
記述言語:英語 掲載種別:研究論文(学術雑誌) 出版者・発行元:PNAS Nexus
Cytosolic sulfotransferases (SULTs) are cytosolic enzymes that catalyze the transfer of sulfonate group to key endogenous compounds, altering the physiological functions of their substrates. SULT enzymes catalyze the O-sulfonation of hydroxy groups or N-sulfonation of amino groups of substrate compounds. In this study, we report the discovery of C-sulfonation of α,β-unsaturated carbonyl groups mediated by a new SULT enzyme, SULT7A1, and human SULT1C4. Enzymatic assays revealed that SULT7A1 is capable of transferring the sulfonate group from 3′-phosphoadenosine 5′-phosphosulfate to the α-carbon of α,β-unsaturated carbonyl-containing compounds, including cyclopentenone prostaglandins as representative endogenous substrates. Structural analyses of SULT7A1 suggest that the C-sulfonation reaction is catalyzed by a novel mechanism mediated by His and Cys residues in the active site. Ligand-activity assays demonstrated that sulfonated 15-deoxy prostaglandin J2 exhibits antagonist activity against the prostaglandin receptor EP2 and the prostacyclin receptor IP. Modification of α,β-unsaturated carbonyl groups via the new prostaglandin-sulfonating enzyme, SULT7A1, may regulate the physiological function of prostaglandins in the gut. Discovery of C-sulfonation of α,β-unsaturated carbonyl groups will broaden the spectrum of potential substrates and physiological functions of SULTs.
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Development of a digital phenotyping system using 3D model reconstruction for zoysiagrass 査読あり
Pongpiyapaiboon S., Tanaka H., Hashiguchi M., Hashiguchi T., Hayashi A., Tanabata T., Isobe S., Akashi R.
Plant Phenome Journal 6 ( 1 ) 2023年12月
掲載種別:研究論文(学術雑誌) 出版者・発行元:Plant Phenome Journal
Digital phenotyping, particularly the use of plant 3D models, is a promising method for high-throughput plant evaluation. Although many recent studies on the topic have been published, further research is needed to apply it to breeding research and other related fields. In this study, using a 3D model phenotyping system we developed, we reconstructed and analyzed 20 accessions of zoysiagrass (Zoysia spp.), including three species and their hybrid, over a period of 1 year. Artificial neural network with three hidden layers was able to effectively remove nonplant parts while retaining plant parts that were incorrectly removed using the cropping method, offering a robust and flexible approach for post-processing of 3D models. The system also demonstrated its ability to accurately evaluate a range of traits, including height, area, and color using red green blue (RGB)-based vegetation indices. The results showed a high correlation between the estimated volume obtained from voxel 3D model and dry weight, enabling its use as a non-destructive method for measuring plant volume. In addition, we found that the green red normalized difference index from RGB-based indices was similar to the commonly used normalized difference vegetation index in controlled illumination conditions. These results demonstrate the potential for three-dimensional model phenotyping to facilitate plant breeding, particularly in the field of turfgrass and feed crops.
DOI: 10.1002/ppj2.20076
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Pakanan Jiamtae*, Takuyu Hashiguchi*, Sorawich Pongpiyapaiboon, Intouch Lelapiyamit, Hidenori Tanaka, Masatsugu Hashiguchi, Ryo Akashi, *Equally contributed
Journal of Crop Science and Biotechnology 26 ( 4 ) 467 - 488 2023年
担当区分:筆頭著者 記述言語:英語 掲載種別:研究論文(学術雑誌) 出版者・発行元:Journal of Crop Science and Biotechnology
Soybean is a major crop that is rich in proteins, lipids, and isoflavones. Although the seeds are widely used for food and industrial purposes, soybean is recognized as a crop that does not store well, as storage conditions greatly affect seed quality. In this study, we selected 10 recombinant inbred lines (RILs) of soybean that are either sensitive or tolerant to storage, and examined the biochemical characteristics of the lines and their parents under storage-related stresses. The germination rates of all of the lines in the tolerant group were higher than those of the sensitive group for all storage conditions. Malondialdehyde (MDA) content was higher in the sensitive group than in the tolerant group, with the MDA content typically increasing under long-term storage conditions. Superoxide dismutase (SOD), peroxidase (POD), and catalase (CAT) activities were also more affected by long-term storage, but not by higher temperatures. Isoflavones were also assayed and it was found that the aglycones (except glycitein) increased with an increase of storage temperature. Malonyl isoflavone glucosides tended to decrease under long-term storage and high temperature conditions, suggesting that malonyl glucosides are converted to their aglycones. These results illustrate the mechanisms underlying storage-related stresses and the importance of screening for lines that can tolerate environmental stresses.
DOI: 10.1007/s12892-023-00192-6
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Construction of prediction models for growth traits of soybean cultivars based on phenotyping in diverse genotype and environment combinations. 査読あり
Manggabarani AM*, Hashiguchi T*, Hashiguchi M, Hayashi A, Kikuchi M, Mustamin Y, Bamba M, Kodama K, Tanabata T, Isobe S, Tanaka H, Akashi R, Nakaya A, Sato S, *Equally contributed.
DNA research 2022年8月
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Tanabata T., Kodama K., Hashiguchi T., Inomata D., Tanaka H., Isobe S.
Breeding Science 72 ( 1 ) 85 - 95 2022年
記述言語:日本語 掲載種別:研究論文(学術雑誌) 出版者・発行元:Breeding Science
Plant phenotyping technology has been actively developed in recent years, but the introduction of these technologies into the field of agronomic research has not progressed as expected, in part due to the need for flexibility and low cost. “DIY” (Do It Yourself) methodologies are an efficient way to overcome such obsta-cles. Devices with modular functionality are critical to DIY experimentation, allowing researchers flexibility of design. In this study, we developed a plant conveyance system using a commercial AGV (Automated Guided Vehicle) as a case study of DIY plant phenotyping. The convey module consists of two devices, a running device and a plant-handling device. The running device was developed based on a commercial AGV Kit. The plant-handling device, plant stands, and pot attachments were originally designed and fabricated by us and our associates. Software was also developed for connecting the devices and operating the system. The run route was set with magnetic tape, which can be easily changed or rerouted. Our plant delivery system was developed with low cost and having high flexibility, as a unit that can contribute to others’ DIY’ plant research efforts as well as our own. It is expected that the developed devices will contribute to diverse phenotype observations of plants in the greenhouse as well as to other important functions in plant breeding and agricultural production.
DOI: 10.1270/jsbbs.21070
MISC 【 表示 / 非表示 】
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核内受容体のリン酸化を介した遺伝子発現制御機構 招待あり
橋口拓勇, 根岸正彦
バイオサイエンスとインダストリー (B&I) Submitted 2023年1月
担当区分:筆頭著者 掲載種別:速報,短報,研究ノート等(学術雑誌)
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環境汚染とヘモグロビン~植物による組換えヘモグロビン研究の最前線~ 招待あり
橋口 拓勇
ファルマシア 58 ( 6 ) 608 - 608 2022年6月
担当区分:筆頭著者 記述言語:日本語 掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌) 出版者・発行元:公益社団法人 日本薬学会
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野生ダイズのゲノム情報および特性解析からみえてきた 遺伝的多様性とダイズのスマート育種への活用に向けて 招待あり
橋口 拓勇, 佐藤 修正, 田中 秀典, 橋口 正嗣
JATAFFジャーナル Submitted 2022年
担当区分:筆頭著者 記述言語:日本語 掲載種別:記事・総説・解説・論説等(大学・研究所紀要)
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NBRPミヤコグサ・ダイズにおけるバイオリソース整備 招待あり
橋口 正嗣,田中 秀典,橋口 拓勇,明石 良
農業および園芸 96 ( 2 ) 153 - 162 2021年2月
記述言語:日本語 掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)
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ヒト cytosolic sulfotransferase発現大腸菌を用いた硫酸化ポリフェノール類の部位選択的合成とその応用
下平武彦, 黒木勝久, 橋口拓勇, 水光正仁, 榊原陽一
硫酸と工業 73 ( 11 ) 127 - 133 2020年11月
掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)
講演・口頭発表等 【 表示 / 非表示 】
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シバ属における新たな形態計測法の検討 – 全周囲画像による3Dモデルの構築と活用–
Sorawich Pongpiyapaiboon, 田中 秀典, 橋口 拓勇, 橋口 正嗣, 林 篤司, 七夕 高也, 兒玉 晋洋, 磯部 祥子, 明石 良
日本育種学会第141回講演会 2022年3月20日
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安定同位体を用いない標準添加法による植物ホルモンの定量
福島公貴, 橋口拓勇, 橋口正嗣, 明石良
植物微生物研究会 2021年9月9日
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蛍光灯およびLED照明下におけるミヤコグサ実験系統の生育特性
橋口正嗣, 橋口拓勇, 田中秀典, 明石良
植物微生物研究会 2021年9月9日
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圃場栽培したミヤコグサの表現型を制御するゲノム領域の解析: 画像解析 を利用したアプローチ
高橋 隼, 番場 大, 三岡, 周子,Yusdar, Mustamin,Madiha, Manggabarani, 磯村 芳, 子,林 篤司, 七夕 高也, 橋口 拓勇, 橋口 正嗣, 藤 修正
日本植物学会
開催年月日: 2021年9月
会議種別:口頭発表(一般)
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標準添加法を用いたミヤコグサにおける植物ホルモン定量法の確立
橋口 拓勇, 福島 公貴, 橋口 正嗣, 田中 秀典, 権藤 崇裕, 明石 良
日本農芸化学会 2021年3月
受賞 【 表示 / 非表示 】
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卓越研究員候補者
2021年10月 日本学術振興会
橋口拓勇
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Featured home page article
2016年9月 Molecular Endocrinology
Hashiguchi, T., Arakawa, S., Takahashi, S., Gonzalez J.F., Sueyoshi, T., Negishi, M.
受賞区分:学会誌・学術雑誌による顕彰 受賞国:日本国
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優秀ポスター賞
2013年6月 P450, UGT, SULT研究会 (現:内外環境応答・代謝酵素研究会)
橋口拓勇
受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞 受賞国:日本国
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Young Investigator Award
2011年8月 日本フードファクター学会(JSoFF)
橋口拓勇
受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞 受賞国:日本国
科研費(文科省・学振・厚労省)獲得実績 【 表示 / 非表示 】
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植物ー微生物間の情報伝達分子としてのフラボノイド硫酸体に関する研究
研究課題/領域番号:23K05027 2023年04月 - 2026年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費基金 基盤研究(C)
担当区分:研究代表者
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翻訳後修飾としてのチロシン硫酸化の空間および時間的強制機構の理解と機能解明
研究課題/領域番号:22H02262 2022年04月 - 2026年03月
独立行政法人日本学術振興会 科学研究費補助金 基盤研究(B)
榊原 陽一、
担当区分:研究分担者
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植物における硫酸転移酵素の生理機能に関する研究
研究課題/領域番号:12J01404 2012年04月 - 2014年03月
科学研究費補助金 特別研究員奨励費
担当区分:研究代表者
その他研究活動 【 表示 / 非表示 】
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日本農芸化学会2024年度大会
2024年03月
ミヤコグサ・ダイズバイオリソース(NBRP)の展示
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第46回日本分子生物学会
2023年12月
ミヤコグサ・ダイズバイオリソース(NBRP)の展示
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日本植物生理学会
2023年03月
ミヤコグサ・ダイズバイオリソース(NBRP)の展示
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第45回日本分子生物学会
2022年11月
ミヤコグサ・ダイズバイオリソース(NBRP)の展示
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日本植物生理学会
2022年03月
ミヤコグサ・ダイズバイオリソース(NBRP)の展示
委員歴 【 表示 / 非表示 】
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日本フードファクタ―学会・日本農芸化学会西日本支部会合同大会 実行委員
2020年11月
団体区分:学協会
西日本支部大会開催予定
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日本プロテオーム学会 実行委員
2019年7月
団体区分:学協会