SAKAKIBARA Yoichi

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Affiliation

Faculty of Agriculture Department of Biochemistry and Applied Biosciences Living thing function science course

Title

Professor

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Degree 【 display / non-display

  • 博士(農学) ( 1995.3   鹿児島大学 )

  • 農学修士 ( 1992.3   宮崎大学 )

Research Areas 【 display / non-display

  • Life Science / Food sciences

  • Life Science / Applied biochemistry

 

Papers 【 display / non-display

  • Molecular cloning and characterization of common marmoset SULT1C subfamily members that catalyze the sulfation of thyroid hormones. Reviewed

    Kurogi, K., Manabe, Y., Liu, M.-C., Suiko, M., Sakakibara, Y.

    Biosci. Biotechnol. Biochem.   85   2113 - 2120   2021.8

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    Authorship:Last author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: doi.org/10.1093/bbb/zbab141

  • The crystal structure of mouse SULT2A8 reveals the mechanism of 7α-hydroxyl, bile acid sulfation

    Teramoto T., Nishio T., Kurogi K., Sakakibara Y., Kakuta Y.

    Biochemical and Biophysical Research Communications   562   15 - 20   2021.7

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    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Biochemical and Biophysical Research Communications  

    Bile acids play essential roles in facilitating the intestinal absorption of lipophilic nutrients as well as regulation of glucose, lipid, and energy homeostasis via activation of some receptors. Bile acids are cytotoxic, and consequently their concentrations are tightly controlled. A critical pathway for bile acid elimination and detoxification is sulfation. The pattern of bile acid sulfation differs by species. Sulfation preferentially occurs at the 3α-OH of bile acids in humans, but at the 7α-OH in mice. A recent study identified mouse cytosolic sulfotransferase 2A8 (mSULT2A8) as the major hepatic 7α-hydroxyl bile acid-sulfating enzyme. To elucidate the 7α-OH specific sulfation mechanism of mSULT2A8, instead of 3α-OH specific sulfation in humans, we determined a crystal structure of mSULT2A8 in complex with cholic acid, a major bile acid, and 3′-phosphoadenosine-5′-phosphate, the sulfate donor product. Our study shows that bile acid-binding mode of mSULT2A8 and how the enzyme holds the 7α-OH group of bile acids at the catalytic center, revealing that the mechanism underlying 7α-OH specific sulfation. The structure shows the substrate binds to mSULT2A8 in an orientation perpendicular to that of human 3α-hydroxyl bile acid-sulfotransferase (hSULT2A1). The structure of the complex provides new insight into species different bile acid metabolism.

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.04.113

    Scopus

  • Proteolytic maturation of the Outer Membrane c-type cytochrome OmcZ by Subtilisin-like Serine Protease is Essential for Optimal Current Production by Geobacter sulfurreducens Reviewed

    AEM.02617-20   2021.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: doi: 10.1128/AEM.02617-20

  • Varietal differences in flavonoid and antioxidant activity in Japanese soybean accessions Reviewed

    85 ( 4 )   916 - 922   2021.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Effects of indole and indoxyl on the intracellular oxidation level and phagocytic activity of differentiated hl-60 human macrophage cells Reviewed

    45 ( 9 )   569 - 579   2020.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

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Books 【 display / non-display

  • 機能性食品開発のための初期評価試験プロトコール集

    山本(前田)万里(監修)( Role: Contributor)

    シーエムシー出版  2017.4 

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    Language:Japanese Book type:Scholarly book

  • プロテオミクス辞典

    日本プロテオーム学会編( Role: Joint author)

    講談社  2013.9 

     More details

    Language:Japanese Book type:Dictionary, encyclopedia

  • 生物機能研究の進歩1

    監修:山田耕路共著者:立花宏文、菅原卓也、江藤望、野田敏司、水光正仁、榊原陽一、岡達三、長田恭一、本城賢一

    アイピーシー全241頁分担 167-172、 181-189頁  2002.6 

MISC 【 display / non-display

  • 宮崎大学医学部附属病院臨床研究支援センター食品臨床試験部門の取り組み.

    有村保次、永濵清子、黒木光歩、長友奈央、長野文子、梶原睦美、平井亜優美、榊原陽一、國武久登、竹島秀雄、片岡寛章.

    宮崎医会誌   45   222 - 230   2021.9

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    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (other)  

  • 完熟きんかん「たまたま」の新しい機能性について -NK細胞賦活効果・抗ストレス効果・抗疲労効果- Invited

    永濵清子、江藤望、有村保次、榊原陽一、水光正仁

    生物工学会誌   99   320 - 322   2021.7

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    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • ヒトcytosolic sulfotransferase 発現大腸菌を用いた硫酸化ポリフェノール類の部位選択的合成とその応用 Invited

    下平武彦、黒木勝久、橋口拓勇、水光正仁、榊原陽一

    硫酸と工業   73   127 - 133   2020.11

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    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)   Publisher:硫酸協会  

  • イオウ元素に着目したプロテオミクス解析技術確立と応用 Invited

    黒木勝久、榊原陽一

    アグリバイオ   4 ( 12 )   69 - 70   2020.11

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    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)   Publisher:北隆館  

  • Multiple functions of sulfate ion during the evolution Invited

    58 ( 9 )   511 - 519   2020.9

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

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Presentations 【 display / non-display

  • 質量分析解析計を用いたレスベラトロール構造異性体の硫酸代謝物解析

    中野悠・黒木勝久・Ming-Cheh Liu・水光正仁・榊原陽一

    日本農芸化学会大会2021年度大会  (紙面)  日本農芸化学会

     More details

    Event date: 2021.3.18 - 2021.3.21

    Language:Japanese  

    Venue:紙面  

  • 細胞質硫酸転移酵素の核内受容体応答に対する網羅的な発現定量解析

    黒木勝久・Ming-Cheh Liu・水光正仁・榊原陽一

    日本農芸化学会大会2021年度大会  (紙面)  日本農芸化学会

     More details

    Event date: 2021.3.18 - 2021.3.21

    Language:Japanese  

    Venue:紙面  

  • ゼブラフィッシュをモデルとしたチロシン硫酸化の生理機能解明

    奥田菜月、黒木勝久、水光正仁、榊原陽一

    2020年度日本フードファクター学会・日本農芸化学会西日本支部合同大会  (宮崎大学)  日本農芸化学会西日本支部

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    Event date: 2020.11.28 - 2020.11.29

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:宮崎大学  

  • 食品成分抱合型代謝産物の質量分析計を用いた解析法の確立

    中野悠、黒木勝久、Ming-Cheh Liu、水光正仁、榊原陽一

    2020年度日本フードファクター学会・日本農芸化学会西日本支部合同大会  (宮崎大学)  日本農芸化学会西日本支部

     More details

    Event date: 2020.11.28 - 2020.11.29

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:宮崎大学  

  • マーカータンパク質の発現パターンによる食品機能予測システムの確立

    大田輝、黒木勝久、永濵清子、水光正仁、榊原陽一

    2020年度日本フードファクター学会・日本農芸化学会西日本支部合同大会  (宮崎大学)  日本農芸化学会西日本支部

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    Event date: 2020.11.28 - 2020.11.29

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:宮崎大学  

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Awards 【 display / non-display

  • 科研費審査委員の表彰

    2015.11   日本学術振興会  

    榊原陽一

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    Country:Japan

  • 農芸化学奨励賞

    2003.3   日本農芸化学会  

    榊原陽一

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    Award type:Award from Japanese society, conference, symposium, etc.  Country:Japan

Grant-in-Aid for Scientific Research 【 display / non-display

  • 神経組織受容体に作用する新規硫酸化生体制御分子の創製

    2015.04 - 2019.03

    科学研究費補助金  基盤研究(B)

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    Authorship:Principal investigator 

    神経組織受容体に作用する新規硫酸化生体制御分子の創製

  • α,β-不飽和カルボニル化合物の新規代謝経路としての硫酸化

    2013.04 - 2015.03

    科学研究費補助金  挑戦的萌芽研究

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    Authorship:Principal investigator 

    生体内における硫酸化は、ステロイドホルモン、神経伝達物質および薬物等の解毒代謝機構として知られ、硫酸 転移酵素(SULT)がその反応を触媒する。これまでの研究から、硫酸化の標的となる分子は、フェノール性やア ルコール性の水酸基または、芳香族アミンなどアミノ基を持つ化合物が広く知られている。本研究計画では、α ,β-不飽和カルボニル構造を持った環状化合物が直接酵素的に硫酸化を受けるという新発見に基づき、その代 謝機構の生理的意義、反応メカニズムの解明を目的とした研究を実施する。

  • 硫酸転移酵素の生理機能と生体シグナルの変換・伝達

    2011.04 - 2014.03

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    Authorship:Coinvestigator(s) 

    硫酸転移酵素の生理機能と生体シグナルの変換・伝達

  • マウスにおける胆汁酸硫酸化の生理機能解明

    2009.04 - 2012.03

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    Authorship:Principal investigator 

    生体内における硫酸化は、生体外異物の解毒代謝機構や内因性の生理活性物質(ステロイドホルモン、カテコールアミン神経伝達物質など)の不活性化と濃度調節機構として研究されてきた。近年、リトコール酸をはじめとした二次胆汁酸の解毒代謝に硫酸化が関与することが知られ注目されている。本研究では、マウスにおいて胆汁酸のC-7位の水酸基を特異的に硫酸化する新規硫酸転移酵素(SULT2A4)の生理機構の解明を目的とした研究を行う。

  • モニター蛍光タンパク質を用いた新規内分泌かく乱作用評価試験の開発

    2003.04 - 2005.03

    科学研究費補助金 

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を用いた内分泌かく乱物質(環境ホルモン)の新規評価試験の開発を目指し研究した。環境中で生成するビスフェノールAの塩素体や臭素体がより強い内分泌かく乱作用を持つ可能性を示した。

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Other research activities 【 display / non-display

  • 次々に明かされる硫酸化シグナルの多彩な役割

    2008.03

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    日本農芸化学会における公募大会シンポジウムとして「次々に明かされる硫酸化シグナルの多彩な役割」というテーマをオーガナイザーとして提案し、採択された。外国人研究者を含めて6名の発表を行い、硫酸化を研究する研究者の情報交換の場を提供した。

  • 硫酸化シグナルの新展開

    2007.12

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    日本分子生物学会・日本生化学会合同大会(BMB2007)における公募ワークショップ「硫酸化シグナルの新展開」をオーガナイザーとして中心となって企画し、7名の講演者による発表を行い、硫酸化に関する研究者の交流につとめた。