YUI Toshifumi

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Affiliation

Engineering educational research section Department of Applied Chemistry Program

Title

Professor

External Link

Degree 【 display / non-display

  • Doctor(Philosophy) ( 1989.9   State University of New York (U.S.A.) )

  • Agriculture ( 1984.3   Osaka Prefecture University )

  • Agriculture ( 1982.3   Osaka Prefecture University )

Research Areas 【 display / non-display

  • Nanotechnology/Materials / Polymer materials  / cellulose, molecular dynamics simulation, polysaccharide, protein

  • Life Science / Structural biochemistry

  • Life Science / Applied biochemistry

  • Life Science / Wood science  / cellulose, molecular dynamics simulation, polysaccharide, protein

 

Papers 【 display / non-display

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Books 【 display / non-display

  • Research Frontier of Biomass Degrading Enzymes-Focused on Cellulases and Hemicellases-

    ( Role: Joint author)

    2012.3 

     More details

    Language:Japanese Book type:Scholarly book

  • Molecular Dynamics Simulations of Cellulose Crystal Models in "Interfacial Researches in Fundamental and Matewrial Sciences of Oligo- Polysaccharides"

    Toshifumi Yui( Role: Sole author ,  分担章の全体)

    Research Signpost  2009.4 

     More details

    Language:English Book type:Scholarly book

  • Three-dimensional Assembly of Chitin and Chitosan in "Material Science of Chitin and Chitosan" (T.Uragami, S.Tokura eds.)

    K.Ogawa, T.Yui( Role: Joint author ,  Cahpter 2, pp.21-49)

    Springer-Verlag, Kodansha  2006.1 

     More details

    Language:English Book type:Scholarly book

  • X-ray Diffraction Study of Polysaccharides in "Polysaccharides, Structural Diversity and Functional Versatility" (S.Dumitriu ed.) 全p.1147

    K.Ogawa, T.Yui( Role: Joint author ,  Chapter 4, p.101-129)

    Mercel Dekker, Inc.  2005.8 

     More details

    Language:English Book type:Scholarly book

  • X-Ray Diffraction Study of Polysaccharides in "Structural Diversity and Functional Versatility of Polysaccharides" Second Edition (S. Dumitriu ed.) 全p.1204

    T.Yui, K.Ogawa( Role: Joint author ,  Chapter 4, pp.99-122)

    Marcel Dekker Inc.  1998.5 

     More details

    Language:English Book type:Scholarly book

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MISC 【 display / non-display

  • 分子レベルから解き明かすセルロース繊維の不思議 Invited

    湯井敏文、宇都卓也

    化学   76 ( 5 )   44 - 48   2021.5

     More details

    Authorship:Corresponding author   Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (trade magazine, newspaper, online media)   Publisher:化学同人  

    古来よりセルロースは人類にとって身近な生体材料であったが、セルロース繊維と繊維を紡ぎだす姿が分子レベルで明らかになったのはこの20年間のことである。それにはX線結晶構造解析や電子顕微鏡観察等の解析手段だけでなく、理論・実験に続く第三の研究手段としての地位を確立した分子シミュレーションが重要な役割を担った。

  • Molecular Dynamics Simulation Study with Substrate Recognition of Carbohydrate Binding Module of Cellobiohydrolase to Cellulose Crystal

    Toshifumi Yui, Hirohide Shiiba

    Bulletin of Applied Glycoscience   2 ( 2 )   129 - 135   2012.5

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)   Publisher:The Japanese Society of Applied Glycoscience  

  • Crystal structure conversions observed in cellulose IIII crystal models

    19 ( 1 )   7 - 11   2012.1

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)   Publisher:The Cellulose Society of Japan  

  • Report of the Lecture Meeting of Research Center of Environmental Harmonized Technology at University of Miyazaki-Visualzing Cellulose Synthesis and Degradation with Molecular Level-

    18 ( 4 )   183 - 185   2011.12

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)   Publisher:The Cellulose Society of Japan  

  • Molecular dynamics simulation study of the native cellulose crystal models

    13 ( 1 )   12 - 17   2006.1

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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Presentations 【 display / non-display

  • Molecular and crystal structure of chitosan-zinc chloride complex

    Kotaro Noda, Takuya Uto, and Toshifumi Yui

    2021.9.30 

     More details

    Event date: 2021.9.30 - 2021.10.1

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

  • Substrate recognition of bacterial expansin

    Ryotaro Hona, Takuya Uto, and Toshifumi Yui

    2021.9.30 

     More details

    Event date: 2021.9.30 - 2021.10.1

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

  • Study on the Formation and Morphology of Curdlan Triple Helix Structure

    Takato Terada, Takuya Uto, Toshifumi Yui

    2021.9.30 

     More details

    Event date: 2021.9.30 - 2021.10.1

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

  • Free energy landscapes of substrate recognition of Cel7A carbohydrate binding module on the cellulose crystal surface

    Ko Tajima, Takuya Uto, and Toshifumi Yui

    2021.9.30 

     More details

    Event date: 2021.9.30 - 2021.10.1

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

  • Chiral recognition of amylose tri(3,5-dimethylphenylcarnamate)

    Naru Iwamoto, Takuya Uto, and Toshifumi Yui

    2021.9.30 

     More details

    Event date: 2021.9.30 - 2021.10.1

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

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Awards 【 display / non-display

  • 平成25年度 セルロース学会林治助賞

    2014.7   セルロース学会  

    湯井敏文

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    Award type:International academic award (Japan or overseas)  Country:Japan

Grant-in-Aid for Scientific Research 【 display / non-display

  • 分子シミュレーションとデータ科学手段の連携による多糖誘導体キラル分離機構の解明

    Grant number:21K05187  2021.04 - 2024.03

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

    湯井敏文、宇都卓也

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    Authorship:Principal investigator 

    生体が光学異性体に対して高い識別能を持つことから、キラルな医薬品の開発・合成・製造過程において生理活性を示す光学異性体の分離が大変重要である。この分離を行う装置の
    部材であるセルロース誘導体キラル充填剤は岡本佳男によって開発され、(株)ダイセルによって、今日、世界のトップシェアを占める種々の多糖誘導体キラル充填剤が商品化された。
    本申請研究は、多糖誘導体が示す光学異性体分離現象を分子論的に解明するために、分子シミュレーション手段を適用する。安定したキラル分離が再現される計算手段を確立し、種々のキラル分子と既存の多糖誘導体充填剤のシミュレーションモデル系へ解析対象を拡げ、それらに共通する分離機構モデルを提案する。シミュレーションが提供するキラル分離の分子描像や熱力学量等の体系的な計算結果と蓄積された膨大な分離実験データに対してデータ駆動型解析を適用し、本申請研究の解析コンセプトを発展させ、キラル分子のin silico絶対構造予測や新規多糖誘導体充填剤の分子・材料設計の可能性を探る。

  • 芳香環酸素添加酵素の機能改変とコンビナトリアルケミストリーへの利用

    2006.06 - 2007.03

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    Authorship:Coinvestigator(s) 

    芳香環酸素添加酵素の機能改変とコンビナトリアルケミストリーへの利用

  • 生理活性糖鎖の光二構造・機能創刊のビジュアル解析

    1999.04 - 2000.03

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

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    Authorship:Coinvestigator(s) 

    企画調査研究として、糖質を対象とした分子モデリング研究の国内、国外の動向を調査した。

  • 血液型特異性糖鎖分子の立体配座解析

    1994.04 - 1995.03

    科学研究費補助金  奨励研究A

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    Authorship:Principal investigator 

    血液型特異性糖鎖分子を対象とした、分子モデリング手段による体系的な立体配座解析を行った。

  • ウイルスによって認識されるリポ多糖ヘキソース部位の3次元立体構造の解明

    1992.04 - 1993.03

    科学研究費補助金  奨励研究A

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    分子モデリング手段によりウィルスによって認識される細菌細胞壁LPS糖鎖の立体配座解析を行った。